Gene
Gene
ID CARD
ID
HGNC:2717
Aliases
DDB1
ENSG00000167986,
HGNC:2717,
NCBI:1642
OFF:DDB1
Chromosome
11
Transcripts
377 ORFs
22 known transcripts
389 ORF to known transcript associations
MetamORF transcript ID The MetamORF ID of the transcript. This is an arbitrary ID that does not correspond to any official (Ensembl, NCBI...) transcript ID or external reference. |
Transcript ID
The official transcript ID (usually an Ensembl ID, e.g. ENST00000395565). |
Transcript name
The transcript name (e.g. MDK-202). |
Transcript biotype
The biotype of the transcript (as defined by Ensembl). |
ORFs
Display all the transcripts related to the entry. |
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8279 | ENST00000301764 | DDB1-201 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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102129 | ENST00000540784 | DDB1-218 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3959 | ENST00000414411 | DDB1-202 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3835 | ENST00000539332 | DDB1-213 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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8365 | ENST00000535283 | DDB1-206 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1130739 | ENST00000540166 | DDB1-217 | nonsense_mediated_decay | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3911 | ENST00000535147 | DDB1-204 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3995 | ENST00000545930 | DDB1-225 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3822 | ENST00000538470 | DDB1-212 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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286012 | ENST00000537120 | DDB1-208 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3314495 | UNKNOWN_TRANSCRIPT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3968 | ENST00000535967 | DDB1-207 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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286019 | ENST00000539426 | DDB1-214 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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4006 | ENST00000535174 | DDB1-205 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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4041 | ENST00000543162 | DDB1-221 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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4085 | ENST00000543627 | DDB1-222 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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4020 | ENST00000541513 | DDB1-219 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3942 | ENST00000537877 | DDB1-209 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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4009 | ENST00000539712 | DDB1-215 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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4072 | ENST00000542337 | DDB1-220 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3990 | ENST00000538280 | DDB1-211 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3898 | ENST00000543658 | DDB1-223 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1821187 | ENST00000545894 | DDB1-224 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ORFs
377 ORFs
22 known transcripts
389 ORF to known transcript associations
MetamORF ORF ID The MetamORF ID of the ORF. This is an unique ID referring to the ORF. |
ORF Length
The genomic length of the ORF (in bp). This length is defined as the sum of the lengths of each exon constituting the ORF (thus excluding its eventual introns) and includes both the start and the stop codons. |
Nucleic sequence The nucleic sequence of the ORF. |
Amino acid sequence The amino acid sequence of the ORF. |
Start codon
The start codon sequence of the ORF. |
ORF annotations
A comma-separated list of all the annotations computed by our algorithm for the ORF. This list includes the annotations computed for the ORF for all transcripts. See the section dedicated to ORF annotations in the advanced documentation for more details regarding the nomenclature we use. |
Cell types
A comma-separated list of all the cell types in which the ORF has already been identified. |
Transcripts
Display all the transcripts related to the entry. |
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916266 | 102 |
AAG... |
KSS... |
AAG |
InCDS Overlapping sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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285978 | 60 |
TTG... |
LCH... |
TTG |
Intronic sORF |
HAP1,
HEK293,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407618 | 141 |
ATT... |
IGL... |
ATT |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3972 | 129 |
CTG... |
LMT... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3839 | 33 |
TTG... |
LSM... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8369 | 138 |
ATG... |
MPA... |
ATG |
sORF Alternative InCDS NMD Overlapping |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS, Brain_tumor, |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8299 | 171 |
ATG... |
MNM... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907733 | 78 |
AGC... |
SGS... |
AGC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8307 | 267 |
ATG... |
MRP... |
ATG |
InCDS NMD Overlapping sORF Alternative |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, BJ, Blood, Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293T, hES, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3937 | 48 |
GTG... |
VNY... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4065 | 90 |
GTG... |
VSL... |
GTG |
ncRNA sORF |
HeLa,
BJ,
Blood,
Brain, Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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3200381 | 177 |
GAG... |
ESW... |
GAG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
286014 | 135 |
TTG... |
LCA... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314530 | 418 |
ATG... |
MYG... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3979 | 192 |
TTG... |
LDI... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3879 | 273 |
CTG... |
LRT... |
CTG |
Intronic sORF |
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HEK293,
HFF, Jurkat |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294170 | 87 |
CTG... |
LKR... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907717 | 36 |
CAG... |
QNQ... |
CAG |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314509 | 801 |
ATG... |
MEH... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
286018 | 81 |
ATG... |
MRC... |
ATG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, BJ, hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907788 | 42 |
TAC... |
YMC... |
TAC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483669 | 84 |
ATG... |
MSL... |
ATG |
sORF Alternative InCDS NMD Overlapping |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, Brain_tumor, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3843 | 87 |
CTG... |
LTR... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285993 | 138 |
CTG... |
LNP... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293T, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102137 | 30 |
GTG... |
VLS... |
GTG |
Intronic sORF ncRNA |
HEK293,
hES,
HFF,
BJ |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8326 | 84 |
TTG... |
LRV... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907811 | 198 |
CGT... |
RKK... |
CGT |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201157 | 84 |
TGC... |
CAQ... |
TGC |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
409560 | 45 |
AGT... |
SIR... |
AGT |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3965 | 69 |
GTG... |
VPW... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314506 | 486 |
ATG... |
MSY... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314521 | 763 |
ATG... |
MVI... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314500 | 611 |
ATG... |
MVY... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8375 | 117 |
ATG... |
MWS... |
ATG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, BJ, Blood, HAP1, HEK293T, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314518 | 910 |
ATG... |
MSE... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
482221 | 51 |
TTG... |
LRP... |
TTG |
Intronic sORF |
Brain,
HAP1,
HEK293T,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3954 | 207 |
TTG... |
LSD... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8324 | 60 |
GTG... |
VPW... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8291 | 177 |
GTG... |
VLW... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4047 | 45 |
ATG... |
MVT... |
ATG |
ncRNA sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8295 | 111 |
TTG... |
LWA... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294175 | 219 |
TTG... |
LTN... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3985 | 201 |
GTG... |
VAC... |
GTG |
Intronic sORF |
HeLa,
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8356 | 261 |
TTG... |
LLS... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907820 | 66 |
CGG... |
RSD... |
CGG |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1512169 | 57 |
TTG... |
LNY... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8332 | 114 |
CTG... |
LNP... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8344 | 180 |
CTG... |
LGL... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8334 | 120 |
ATG... |
MHL... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8313 | 144 |
ATG... |
MRS... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8285 | 156 |
ATG... |
MTI... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3956 | 210 |
CTG... |
LLS... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907759 | 111 |
TCC... |
SSS... |
TCC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907813 | 33 |
CAT... |
HSS... |
CAT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907783 | 87 |
AAC... |
NNS... |
AAC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907726 | 54 |
AGA... |
RLP... |
AGA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4022 | 54 |
TTG... |
LFF... |
TTG |
Intronic sORF |
HAP1,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, hES, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4032 | 48 |
ATG... |
MVL... |
ATG |
Intronic sORF InCDS NMD Overlapping |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, Brain_tumor, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314527 | 496 |
ATG... |
MYG... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102085 | 195 |
CTG... |
LVT... |
CTG |
Intronic sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, hES |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3893 | 123 |
TTG... |
LWA... |
TTG |
Intronic sORF |
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8362 | 207 |
GTG... |
VSL... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HCT116, HEK293, HeLa, hES, HFF, Jurkat, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3821 | 63 |
TTG... |
LRV... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3941 | 60 |
CTG... |
LSS... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407625 | 117 |
GGG... |
GAF... |
GGG |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294182 | 51 |
ATG... |
MTL... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8342 | 141 |
ATG... |
MEL... |
ATG |
InCDS NMD Overlapping sORF Alternative |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, BJ, Blood, HAP1, HEK293T, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1316920 | 108 |
TTG... |
LKL... |
TTG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201153 | 135 |
ACC... |
TSC... |
ACC |
InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407597 | 33 |
CCA... |
PRL... |
CCA |
Intronic sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407631 | 78 |
AAG... |
KAG... |
AAG |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1130803 | 30 |
ATG... |
MMA... |
ATG |
sORF Alternative InCDS NMD Overlapping |
Blood,
HAP1,
HEK293,
hES, MDA-MB-231, Brain_tumor, HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3970 | 93 |
TTG... |
LRV... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907822 | 60 |
GGA... |
GRF... |
GGA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3877 | 42 |
CTG... |
LSA... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907729 | 162 |
AAT... |
NVF... |
AAT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907779 | 120 |
CCA... |
PSM... |
CCA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3944 | 72 |
CTG... |
LTA... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4013 | 96 |
CTG... |
LLA... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3989 | 48 |
ATG... |
MEG... |
ATG |
ncRNA sORF Alternative InCDS NMD Overlapping |
HEK293,
MDA-MB-231,
Brain_tumor,
HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294180 | 30 |
TTG... |
LWA... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
hES,
LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3847 | 42 |
ATG... |
MPL... |
ATG |
Intronic sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285976 | 42 |
GTG... |
VPL... |
GTG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4055 | 108 |
CTG... |
LQS... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907802 | 51 |
ATA... |
IAA... |
ATA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4008 | 78 |
TTG... |
LLW... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3927 | 123 |
GTG... |
VTL... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1047650 | 45 |
TTG... |
LAC... |
TTG |
sORF |
Blood, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201155 | 60 |
ACA... |
TSP... |
ACA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4005 | 69 |
CTG... |
LRS... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3895 | 195 |
CTG... |
LGK... |
CTG |
Intronic sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, hES |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3994 | 36 |
GTG... |
VAT... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4076 | 51 |
GTG... |
VAR... |
GTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285911 | 111 |
CTG... |
LRR... |
CTG |
Intronic sORF |
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HEK293,
LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4034 | 54 |
TTG... |
LIM... |
TTG |
Intronic sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407590 | 144 |
AAT... |
NRL... |
AAT |
Intronic sORF |
HCT116, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
409565 | 105 |
AGA... |
RAL... |
AGA |
sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
409562 | 240 |
CGT... |
RET... |
CGT |
ncRNA sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407627 | 171 |
GTT... |
VDS... |
GTT |
Intronic sORF |
HCT116, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102088 | 177 |
CTG... |
LGE... |
CTG |
InCDS NMD Overlapping sORF Intronic |
HEK293,
BJ,
Brain,
guo_2014, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314533 | 438 |
ATG... |
MSY... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102144 | 96 |
TTG... |
LRI... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200373 | 60 |
AGA... |
RVS... |
AGA |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1725443 | 33 |
ATG... |
MKW... |
ATG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF Intronic |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, Blood, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8348 | 213 |
TTG... |
LDR... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
286021 | 30 |
TTG... |
LAS... |
TTG |
sORF |
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1008215 | 255 |
GTG... |
VCH... |
GTG |
Intronic sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314512 | 722 |
ATG... |
MLN... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8309 | 276 |
CTG... |
LLL... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314524 | 546 |
ATG... |
MMT... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407616 | 138 |
CGC... |
RSI... |
CGC |
Intronic sORF |
HCT116, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907796 | 72 |
ATT... |
IGL... |
ATT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294209 | 186 |
ATG... |
MVT... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF NMD |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, Brain_tumor, |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
916268 | 297 |
GCC... |
ASI... |
GCC |
ncRNA sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407594 | 189 |
ACC... |
TSL... |
ACC |
Intronic sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3826 | 84 |
GTG... |
VFL... |
GTG |
Intronic sORF |
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3889 | 150 |
GTG... |
VAE... |
GTG |
Intronic sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, hES |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294188 | 72 |
CTG... |
LTL... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4040 | 45 |
TTG... |
LAA... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3910 | 69 |
CTG... |
LFA... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907753 | 144 |
GAA... |
EKE... |
GAA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907731 | 60 |
AGG... |
RLV... |
AGG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1731789 | 48 |
ATG... |
MER... |
ATG |
InCDS NMD Overlapping sORF Alternative |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, Blood, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8328 | 72 |
ATG... |
MIS... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF NMD |
BJ,
Blood,
Brain,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS, Brain_tumor, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907844 | 126 |
CGC... |
RRG... |
CGC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201159 | 99 |
CAA... |
QWC... |
CAA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3834 | 57 |
GTG... |
VRL... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294166 | 36 |
ATG... |
MEN... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8338 | 135 |
GTG... |
VLV... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HAP1,
HEK293,
HEK293T,
LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4061 | 135 |
CTG... |
LSI... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293, hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294207 | 183 |
GTG... |
VTN... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1008172 | 150 |
GTG... |
VYP... |
GTG |
Intronic sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294186 | 60 |
GTG... |
VRL... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3923 | 114 |
TTG... |
LFC... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3935 | 30 |
GTG... |
VSP... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, Jurkat, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4074 | 39 |
TTG... |
LTS... |
TTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1205630 | 33 |
ATG... |
MAP... |
ATG |
Intronic sORF |
HAP1,
HEK293,
HeLa,
HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200387 | 42 |
TGT... |
CLL... |
TGT |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4080 | 78 |
ATG... |
MPA... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4045 | 42 |
GTG... |
VTN... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3967 | 48 |
TTG... |
LCL... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4015 | 51 |
TTG... |
LSI... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483639 | 219 |
GTG... |
VLS... |
GTG |
ncRNA sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, loayza_puch_2016 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407635 | 93 |
CAT... |
HVW... |
CAT |
sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907766 | 48 |
AGG... |
RPS... |
AGG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907775 | 30 |
GCT... |
AAH... |
GCT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105174 | 258 |
CTG... |
LRS... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407608 | 39 |
GGA... |
GSE... |
GGA |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
409567 | 123 |
AGT... |
SIN... |
AGT |
sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407633 | 87 |
TGG... |
WED... |
TGG |
sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1130785 | 93 |
GTG... |
VVD... |
GTG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8305 | 255 |
TTG... |
LEK... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907853 | 54 |
CTA... |
LRG... |
CTA |
sORF |
BJ, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314536 | 328 |
ATG... |
MSY... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8373 | 69 |
ATG... |
MGR... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407610 | 123 |
AGC... |
SKL... |
AGC |
Intronic sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907806 | 108 |
TTC... |
FVL... |
TTC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8364 | 99 |
TTG... |
LTS... |
TTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8311 | 105 |
ATG... |
MSL... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, hES, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907764 | 132 |
GTA... |
VSS... |
GTA |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3952 | 189 |
GTG... |
VTL... |
GTG |
Intronic sORF |
HEK293,
Jurkat,
BJ,
Blood, Brain, Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3828 | 102 |
GTG... |
VFP... |
GTG |
Intronic sORF |
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201162 | 102 |
CAG... |
QQW... |
CAG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907722 | 33 |
GCT... |
ARC... |
GCT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3977 | 159 |
CTG... |
LSP... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1094710 | 30 |
TTG... |
LGS... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1297343 | 96 |
CTG... |
LTL... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3997 | 45 |
CTG... |
LWQ... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907724 | 42 |
CCA... |
PHK... |
CCA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1297349 | 156 |
TTG... |
LVC... |
TTG |
Intronic sORF |
HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8354 | 258 |
CTG... |
LSF... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907815 | 33 |
GGT... |
GLS... |
GGT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200395 | 87 |
GCA... |
APP... |
GCA |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2315134 | 42 |
GTG... |
VWP... |
GTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407641 | 159 |
CAA... |
QKH... |
CAA |
sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200371 | 84 |
TAT... |
YDD... |
TAT |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907748 | 120 |
CAA... |
QPL... |
CAA |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8330 | 99 |
TTG... |
LFQ... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483667 | 78 |
TTG... |
LMS... |
TTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3875 | 123 |
GTG... |
VQP... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285982 | 108 |
TTG... |
LLG... |
TTG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3929 | 42 |
CTG... |
LHI... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3855 | 69 |
ATG... |
MMT... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8346 | 240 |
TTG... |
LSI... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HEK293T, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8367 | 111 |
GTG... |
VAR... |
GTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294205 | 171 |
ATG... |
MLS... |
ATG |
ncRNA sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
286011 | 108 |
ATG... |
MAQ... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
916270 | 156 |
GTC... |
VEA... |
GTC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201169 | 150 |
CCA... |
PSM... |
CCA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907838 | 33 |
AGC... |
SEV... |
AGC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1047640 | 84 |
CTG... |
LLG... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3948 | 162 |
TTG... |
LRT... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3891 | 99 |
CTG... |
LKR... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3999 | 57 |
ATG... |
MIS... |
ATG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200379 | 168 |
ACC... |
TSC... |
ACC |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3824 | 60 |
CTG... |
LEI... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407637 | 132 |
GGT... |
GHR... |
GGT |
sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
937571 | 159 |
CTG... |
LLD... |
CTG |
Intronic sORF |
Brain, guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102081 | 183 |
CTG... |
LSE... |
CTG |
Intronic sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HEK293 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285974 | 36 |
TTG... |
LAS... |
TTG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907744 | 57 |
TGC... |
CAQ... |
TGC |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3931 | 93 |
CTG... |
LAN... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285980 | 60 |
ATG... |
MDC... |
ATG |
Intronic sORF Alternative InCDS NMD Overlapping |
Blood,
HEK293,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231, Brain_tumor, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907847 | 177 |
CTT... |
LKP... |
CTT |
sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3904 | 183 |
ATG... |
MNM... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2125264 | 69 |
CTG... |
LLQ... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3933 | 99 |
CTG... |
LAL... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102133 | 210 |
GTG... |
VRL... |
GTG |
ncRNA sORF Intronic |
HCT116,
Jurkat,
Brain,
guo_2014, HEK293, HEK293T, hES, HFF, loayza_puch_2016, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1309961 | 132 |
CAG... |
QNL... |
CAG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9206 | 60 |
ATG... |
MGR... |
ATG |
ncRNA sORF |
BJ,
HEK293,
HFF,
loayza_puch_2016, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907830 | 39 |
ACA... |
TNT... |
ACA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3841 | 57 |
TTG... |
LVF... |
TTG |
sORF Intronic |
HFF,
BJ,
Blood,
Brain, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483665 | 75 |
ATG... |
MSS... |
ATG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
hES, Jurkat, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285991 | 123 |
TTG... |
LFQ... |
TTG |
Intronic sORF |
HAP1,
HEK293,
HEK293T,
LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407601 | 63 |
GAT... |
DDN... |
GAT |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3857 | 69 |
TTG... |
LDD... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483663 | 60 |
ATG... |
MVA... |
ATG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4011 | 132 |
CTG... |
LVT... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
916264 | 84 |
GGA... |
GRS... |
GGA |
InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4087 | 42 |
ATG... |
MGR... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907740 | 33 |
ACA... |
TSP... |
ACA |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
482273 | 102 |
TTG... |
LMS... |
TTG |
sORF |
HEK293, HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200414 | 45 |
GAC... |
DFS... |
GAC |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407629 | 198 |
ACA... |
TYL... |
ACA |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3861 | 84 |
CTG... |
LWK... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4059 | 120 |
TTG... |
LLS... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3869 | 45 |
TTG... |
LSV... |
TTG |
Intronic sORF |
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, LCL, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3961 | 57 |
ATG... |
MER... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407606 | 210 |
TTC... |
FIL... |
TTC |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907777 | 45 |
AAG... |
KLH... |
AAG |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
937580 | 141 |
CTG... |
LVM... |
CTG |
Intronic sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8350 | 231 |
TTG... |
LGG... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907785 | 30 |
CTC... |
LNS... |
CTC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8371 | 60 |
TTG... |
LRS... |
TTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3865 | 30 |
CTG... |
LDE... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HCT116, HEK293, HeLa, hES, Jurkat, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907736 | 60 |
GAC... |
DNF... |
GAC |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4049 | 72 |
TTG... |
LDR... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, Monocyte, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294184 | 54 |
CTG... |
LMT... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4001 | 102 |
GTG... |
VDD... |
GTG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, hES, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8352 | 249 |
CTG... |
LQS... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907842 | 75 |
AGG... |
RGF... |
AGG |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3837 | 36 |
TTG... |
LPR... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3832 | 42 |
CTG... |
LVQ... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907751 | 99 |
GGG... |
GKL... |
GGG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1297347 | 144 |
ATG... |
MHL... |
ATG |
Intronic sORF |
HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907770 | 108 |
TTC... |
FGV... |
TTC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8320 | 252 |
TTG... |
LPH... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HAP1,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, hES, HFF, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3887 | 120 |
CTG... |
LAP... |
CTG |
Intronic sORF |
HAP1,
HEK293,
HeLa,
LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102139 | 33 |
TTG... |
LVL... |
TTG |
Intronic sORF ncRNA |
BJ,
HEK293,
hES,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907828 | 30 |
GAT... |
DCV... |
GAT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3958 | 39 |
TTG... |
LGS... |
TTG |
Intronic sORF |
Brain,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8318 | 156 |
TTG... |
LAP... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
937578 | 126 |
CTG... |
LGE... |
CTG |
Intronic sORF |
Brain | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2125262 | 66 |
CTG... |
LQS... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907794 | 75 |
GTC... |
VFS... |
GTC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102131 | 204 |
TTG... |
LVS... |
TTG |
Intronic sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
hES, HFF, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907768 | 66 |
GGG... |
GGT... |
GGG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3950 | 183 |
TTG... |
LGT... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8287 | 159 |
ATG... |
MMT... |
ATG |
sORF Alternative InCDS Overlapping NMD |
BJ,
Blood,
HAP1, HEK293, hES, MDA-MB-231, Brain_tumor, HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294195 | 111 |
TTG... |
LTY... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407599 | 30 |
AAC... |
NLF... |
AAC |
Intronic sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907761 | 30 |
GCT... |
AVL... |
GCT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4028 | 42 |
TTG... |
LCL... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8293 | 66 |
TTG... |
LPT... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8358 | 276 |
CTG... |
LSI... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1008198 | 114 |
GTG... |
VVV... |
GTG |
Intronic sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200391 | 186 |
CTT... |
LFH... |
CTT |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
916272 | 162 |
GAA... |
ENV... |
GAA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8278 | 90 |
GTG... |
VWG... |
GTG |
InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
634873 | 45 |
CTG... |
LDG... |
CTG |
Intronic sORF |
HAP1,
HEK293,
HeLa,
hES, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3853 | 66 |
ATG... |
MTI... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102083 | 192 |
GTG... |
VTS... |
GTG |
Intronic sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, hES |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8297 | 165 |
ATG... |
MPS... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407584 | 81 |
GAC... |
DDG... |
GAC |
Intronic sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907824 | 33 |
TGG... |
WCC... |
TGG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3859 | 78 |
GTG... |
VEI... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1008200 | 138 |
GTG... |
VAS... |
GTG |
Intronic sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4063 | 138 |
GTG... |
VLS... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293, hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
482271 | 99 |
ATG... |
MSS... |
ATG |
sORF |
HEK293, HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2315165 | 57 |
TTG... |
LAA... |
TTG |
sORF |
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1047626 | 48 |
TTG... |
LNY... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
HEK293,
hES
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4019 | 30 |
TTG... |
LTV... |
TTG |
Intronic sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3897 | 63 |
CTG... |
LQA... |
CTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
hES,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3881 | 30 |
GTG... |
VDN... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4043 | 63 |
ATG... |
MTV... |
ATG |
ncRNA sORF |
HEK293, HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
482188 | 36 |
CTG... |
LQT... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
286029 | 63 |
GTG... |
VSR... |
GTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3902 | 177 |
ATG... |
MPS... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294202 | 231 |
TTG... |
LRG... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293,
HEK293T,
HeLa,
HFF, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3921 | 63 |
CTG... |
LQE... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3963 | 87 |
TTG... |
LGD... |
TTG |
Intronic sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
hES, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3871 | 63 |
ATG... |
MLS... |
ATG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3915 | 30 |
GTG... |
VFR... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285998 | 63 |
GTG... |
VRG... |
GTG |
Intronic sORF |
LCL, MM1S | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105172 | 222 |
TTG... |
LVL... |
TTG |
ncRNA sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, loayza_puch_2016 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201149 | 78 |
AGA... |
RVS... |
AGA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907746 | 222 |
ACC... |
TKG... |
ACC |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294218 | 33 |
TTG... |
LST... |
TTG |
sORF |
HEK293T,
hES,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8281 | 132 |
ATG... |
MPL... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3867 | 30 |
TTG... |
LLE... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314497 | 3279 |
ATG... |
MSY... |
ATG |
CDS NMD |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3883 | 72 |
ATG... |
MSG... |
ATG |
InCDS NMD Overlapping sORF Intronic |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, BJ, Blood, Brain, Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293T, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3863 | 87 |
GTG... |
VLW... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907800 | 90 |
AGC... |
SNH... |
AGC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8336 | 132 |
TTG... |
LVC... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HAP1,
HEK293,
HEK293T,
LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201164 | 144 |
GCA... |
ASW... |
GCA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4053 | 90 |
TTG... |
LGG... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1008194 | 108 |
GTG... |
VAV... |
GTG |
Intronic sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407621 | 51 |
CGT... |
RET... |
CGT |
Intronic sORF |
HCT116, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
937593 | 135 |
GTG... |
VKG... |
GTG |
Intronic sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407588 | 51 |
ACA... |
TPS... |
ACA |
Intronic sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294168 | 57 |
TTG... |
LWS... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
HEK293,
HeLa,
hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2315137 | 75 |
GTG... |
VNG... |
GTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8360 | 279 |
GTG... |
VLS... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102149 | 141 |
GTG... |
VAM... |
GTG |
Intronic sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HeLa, hES, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4024 | 36 |
TTG... |
LSG... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4057 | 117 |
CTG... |
LSF... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4030 | 45 |
GTG... |
VLC... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1008196 | 111 |
GTG... |
VVA... |
GTG |
Intronic sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907849 | 198 |
ACA... |
TLY... |
ACA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294162 | 81 |
TTG... |
LRV... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3925 | 117 |
CTG... |
LLF... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3873 | 39 |
TTG... |
LPT... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483636 | 51 |
GTG... |
VAT... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
917262 | 33 |
CCT... |
PGY... |
CCT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200404 | 237 |
GCC... |
ALY... |
GCC |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907742 | 42 |
AGT... |
SAA... |
AGT |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314494 | 3423 |
ATG... |
MSY... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200421 | 87 |
GTA... |
VAI... |
GTA |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907772 | 123 |
GAA... |
EVS... |
GAA |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407612 | 135 |
ATC... |
ICY... |
ATC |
Intronic sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8340 | 135 |
TTG... |
LES... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4084 | 33 |
TTG... |
LRS... |
TTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200389 | 36 |
AGT... |
SLS... |
AGT |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3900 | 210 |
CTG... |
LVS... |
CTG |
Intronic sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, hES, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1821186 | 42 |
TTG... |
LSS... |
TTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3939 | 78 |
TTG... |
LVF... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907798 | 39 |
ACA... |
TNW... |
ACA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102102 | 165 |
GTG... |
VGT... |
GTG |
Intronic sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201167 | 93 |
GGA... |
GRS... |
GGA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200419 | 60 |
CCA... |
PLP... |
CCA |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
294197 | 120 |
ATG... |
MPA... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3919 | 51 |
CTG... |
LLP... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907781 | 69 |
ATT... |
IGT... |
ATT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8301 | 192 |
ATG... |
MPT... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3946 | 81 |
TTG... |
LLV... |
TTG |
Intronic sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3908 | 204 |
ATG... |
MPT... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4071 | 30 |
GTG... |
VPD... |
GTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HFF,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8283 | 138 |
CTG... |
LKM... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8289 | 174 |
CTG... |
LWK... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407604 | 108 |
CGA... |
RDF... |
CGA |
Intronic sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3917 | 120 |
GTG... |
VSQ... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102128 | 180 |
CTG... |
LVS... |
CTG |
Intronic sORF |
guo_2014,
HEK293,
U2OS
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
482275 | 108 |
ATG... |
MSL... |
ATG |
sORF |
HEK293,
HEK293T,
hES
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1316918 | 102 |
TTG... |
LPS... |
TTG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1825347 | 42 |
GTG... |
VRQ... |
GTG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
916279 | 126 |
TGG... |
WSI... |
TGG |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907808 | 69 |
GGG... |
GHP... |
GGG |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8322 | 258 |
GTG... |
VEL... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HAP1,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, hES |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3849 | 48 |
CTG... |
LKM... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907792 | 54 |
AAG... |
KEV... |
AAG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3906 | 234 |
CTG... |
LQN... |
CTG |
Intronic sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407592 | 180 |
TCA... |
SES... |
TCA |
Intronic sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3845 | 96 |
CTG... |
LPP... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907818 | 51 |
TTC... |
FSI... |
TTC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
916276 | 90 |
AGC... |
SCM... |
AGC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3851 | 51 |
CTG... |
LGA... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907757 | 123 |
CTG... |
LLL... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314515 | 816 |
ATG... |
MET... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8303 | 204 |
TTG... |
LKC... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3913 | 39 |
TTG... |
LKS... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907755 | 90 |
GAG... |
ETS... |
GAG |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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907804 | 87 |
ACG... |
TSL... |
ACG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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4089 | 90 |
ATG... |
MWS... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
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|
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3885 | 111 |
TTG... |
LAE... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285985 | 93 |
ATG... |
MLG... |
ATG |
ncRNA sORF |
HEK293, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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4003 | 114 |
CTG... |
LMG... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, THP-1 |
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Export data