Gene
Gene
ID CARD
ID
HGNC:13831
Aliases
BRWD2
DR11,
ENSG00000120008,
FLJ10506
HGNC:13831,
HH14,
KIAA1351
NCBI:55717,
OFF:WDR11,
SRI1
WDR11,
WDR15
Chromosome
10
Transcripts
153 ORFs
16 known transcripts
157 ORF to known transcript associations
MetamORF transcript ID The MetamORF ID of the transcript. This is an arbitrary ID that does not correspond to any official (Ensembl, NCBI...) transcript ID or external reference. |
Transcript ID
The official transcript ID (usually an Ensembl ID, e.g. ENST00000395565). |
Transcript name
The transcript name (e.g. MDK-202). |
Transcript biotype
The biotype of the transcript (as defined by Ensembl). |
ORFs
Display all the transcripts related to the entry. |
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3698714 | ENST00000605543 | WDR11-216 | nonsense_mediated_decay | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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98923 | ENST00000497136 | WDR11-205 | nonsense_mediated_decay | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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98960 | ENST00000605320 | WDR11-214 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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98957 | ENST00000478567 | WDR11-204 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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446 | ENST00000604509 | WDR11-208 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3300959 | UNKNOWN_TRANSCRIPT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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279854 | ENST00000263461 | WDR11-201 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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439 | ENST00000603658 | WDR11-206 | retained_intron | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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899660 | ENST00000462529 | WDR11-202 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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2304021 | ENST00000605376 | WDR11-215 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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98976 | ENST00000604714 | WDR11-210 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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278785 | ENST00000470052 | WDR11-203 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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525257 | ENST00000605069 | WDR11-211 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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98932 | ENST00000604220 | WDR11-207 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1296705 | ENST00000605202 | WDR11-213 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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524998 | ENST00000605178 | WDR11-212 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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1296398 | ENST00000604585 | WDR11-209 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
ORFs
153 ORFs
16 known transcripts
157 ORF to known transcript associations
MetamORF ORF ID The MetamORF ID of the ORF. This is an unique ID referring to the ORF. |
ORF Length
The genomic length of the ORF (in bp). This length is defined as the sum of the lengths of each exon constituting the ORF (thus excluding its eventual introns) and includes both the start and the stop codons. |
Nucleic sequence The nucleic sequence of the ORF. |
Amino acid sequence The amino acid sequence of the ORF. |
Start codon
The start codon sequence of the ORF. |
ORF annotations
A comma-separated list of all the annotations computed by our algorithm for the ORF. This list includes the annotations computed for the ORF for all transcripts. See the section dedicated to ORF annotations in the advanced documentation for more details regarding the nomenclature we use. |
Cell types
A comma-separated list of all the cell types in which the ORF has already been identified. |
Transcripts
Display all the transcripts related to the entry. |
||||||||||||||||||||||||||||||||
278820 | 30 |
ATG... |
MWT... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF ncRNA |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2303982 | 54 |
ATG... |
MQI... |
ATG |
Alternative NMD sORF Upstream |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1720013 | 54 |
TTG... |
LLD... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
hES,
HFF,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278809 | 33 |
CTG... |
LGL... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899657 | 162 |
GAA... |
ENY... |
GAA |
NMD sORF Upstream |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1720002 | 48 |
TTG... |
LLF... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1983971 | 72 |
GTG... |
VSD... |
GTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3300964 | 3675 |
ATG... |
MLP... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304006 | 54 |
ATG... |
MVL... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF ncRNA |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2303964 | 120 |
GTG... |
VVV... |
GTG |
NMD sORF Upstream |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2303980 | 81 |
CTG... |
LAP... |
CTG |
Alternative NMD sORF Upstream |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1720499 | 66 |
GTG... |
VST... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278791 | 36 |
CTG... |
LMS... |
CTG |
Alternative NMD sORF Upstream |
HEK293,
HeLa,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1314199 | 183 |
TTG... |
LLL... |
TTG |
Intronic sORF |
HEK293, hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3199645 | 66 |
GCC... |
ATG... |
GCC |
ncRNA sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304020 | 108 |
GTG... |
VVT... |
GTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3110724 | 75 |
CTG... |
LDI... |
CTG |
ncRNA sORF |
hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278834 | 33 |
CTG... |
LLY... |
CTG |
ncRNA sORF |
LCL, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278787 | 30 |
TTG... |
LLM... |
TTG |
ncRNA sORF |
HAP1,
HEK293,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1314201 | 180 |
CTG... |
LLE... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293, hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100290 | 207 |
GTG... |
VEA... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
hES,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2303974 | 102 |
TTG... |
LCS... |
TTG |
Alternative NMD sORF Upstream |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
632338 | 108 |
CTG... |
LAA... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304023 | 36 |
TTG... |
LQL... |
TTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98931 | 165 |
CTG... |
LRE... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1296704 | 78 |
CTG... |
LVR... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293T, MM1S | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98936 | 141 |
CTG... |
LLT... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278803 | 39 |
CTG... |
LQF... |
CTG |
InCDS NMD Overlapping sORF |
HAP1,
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
279856 | 45 |
ATG... |
MME... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF InCDS Overlapping |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304039 | 48 |
CTG... |
LCG... |
CTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2303998 | 51 |
CTG... |
LVC... |
CTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1719997 | 36 |
ATG... |
MIY... |
ATG |
InCDS NMD Overlapping sORF |
Blood,
MDA-MB-231,
RPE-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1134698 | 126 |
TTG... |
LTS... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293, hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
405577 | 144 |
TTG... |
LNP... |
TTG |
ncRNA sORF |
HCT116,
HEK293,
hES,
HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278807 | 42 |
ATG... |
MAK... |
ATG |
ncRNA sORF Alternative Downstream NMD |
LCL,
MDA-MB-231,
Brain_tumor,
HEK293, HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
524997 | 87 |
TTG... |
LPY... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98962 | 186 |
CTG... |
LHF... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98922 | 171 |
TTG... |
LWN... |
TTG |
Alternative NMD sORF Upstream |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1719999 | 111 |
GTG... |
VCC... |
GTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304002 | 33 |
CTG... |
LWN... |
CTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2305948 | 117 |
ATG... |
MII... |
ATG |
sORF Alternative Downstream NMD InCDS Overlapping |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa, HFF, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3300961 | 936 |
ATG... |
MLL... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
279858 | 42 |
ATG... |
MEL... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1134690 | 141 |
CTG... |
LLA... |
CTG |
Alternative NMD sORF Upstream |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1720022 | 30 |
GTG... |
VCR... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98954 | 99 |
CTG... |
LEL... |
CTG |
ncRNA sORF |
HAP1,
HEK293,
HeLa,
hES, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899655 | 75 |
GTG... |
VNF... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, Jurkat, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98978 | 45 |
TTG... |
LNE... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
99524 | 288 |
CTG... |
LHS... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278818 | 135 |
TTG... |
LDV... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3014689 | 36 |
CTG... |
LGW... |
CTG |
ncRNA sORF |
MM1S | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
525259 | 69 |
GTG... |
VSA... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98952 | 126 |
TTG... |
LAV... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2541198 | 102 |
GTG... |
VPL... |
GTG |
InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304018 | 54 |
ATG... |
MLG... |
ATG |
Downstream NMD sORF ncRNA |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98968 | 81 |
GTG... |
VKR... |
GTG |
Intronic sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2541196 | 216 |
GTG... |
VYH... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293, hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
281811 | 87 |
ATG... |
MII... |
ATG |
ncRNA sORF |
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
631872 | 108 |
GTG... |
VWC... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
hES,
MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2303988 | 39 |
GTG... |
VMV... |
GTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
MDA-MB-231, RPE-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
279860 | 39 |
TTG... |
LEW... |
TTG |
InCDS Overlapping sORF |
HEK293, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98950 | 45 |
CTG... |
LLH... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278826 | 99 |
TTG... |
LAS... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
HEK293,
HeLa,
hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2092330 | 69 |
TTG... |
LQL... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98925 | 111 |
GTG... |
VLW... |
GTG |
Alternative NMD sORF Upstream |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2303967 | 114 |
GTG... |
VES... |
GTG |
NMD sORF Upstream |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
525256 | 93 |
TTG... |
LPY... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1720016 | 36 |
ATG... |
MTC... |
ATG |
ncRNA sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98942 | 117 |
CTG... |
LPA... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
hES,
HFF
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2303969 | 147 |
ATG... |
MLP... |
ATG |
Alternative NMD sORF Upstream |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98927 | 186 |
TTG... |
LAY... |
TTG |
NMD Overlapping sORF Upstream |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1134693 | 75 |
CTG... |
LAT... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293, hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
632341 | 81 |
GTG... |
VNF... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304013 | 33 |
TTG... |
LLP... |
TTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2305940 | 171 |
TTG... |
LIQ... |
TTG |
InCDS Overlapping sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98934 | 156 |
GTG... |
VHL... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98970 | 189 |
GTG... |
VQL... |
GTG |
Intronic sORF |
HEK293, hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98975 | 117 |
TTG... |
LKN... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
hES,
HFF, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278815 | 177 |
GTG... |
VSS... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98948 | 66 |
GTG... |
VYH... |
GTG |
ncRNA sORF |
HAP1,
HEK293,
HeLa,
hES, HFF, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98959 | 66 |
TTG... |
LKA... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2309182 | 144 |
ATG... |
MME... |
ATG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1296397 | 57 |
CTG... |
LGL... |
CTG |
sORF |
HEK293T, MM1S | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3300958 | 600 |
ATG... |
MLL... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278828 | 45 |
GTG... |
VHQ... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
hES,
LCL,
MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
443 | 69 |
CTG... |
LQT... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304000 | 48 |
GTG... |
VCH... |
GTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304051 | 57 |
CTG... |
LSP... |
CTG |
Intronic sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1314680 | 105 |
GTG... |
VID... |
GTG |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
441 | 102 |
CTG... |
LID... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293,
HeLa,
HFF
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2309180 | 141 |
ATG... |
MEL... |
ATG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98944 | 78 |
TTG... |
LTT... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98946 | 69 |
CTG... |
LVY... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98964 | 156 |
CTG... |
LHS... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3014861 | 75 |
GTG... |
VRT... |
GTG |
ncRNA sORF |
MM1S | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
448 | 42 |
CTG... |
LGC... |
CTG |
ncRNA sORF |
HAP1,
HEK293,
hES,
HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
279853 | 33 |
GTG... |
VKS... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1720018 | 60 |
CTG... |
LCS... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899662 | 66 |
AAC... |
NIK... |
AAC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3110722 | 87 |
CTG... |
LSN... |
CTG |
ncRNA sORF |
hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1314203 | 177 |
TTG... |
LET... |
TTG |
Intronic sORF |
HEK293, hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1720006 | 36 |
GTG... |
VKE... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1314678 | 111 |
GTG... |
VVV... |
GTG |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278824 | 105 |
GTG... |
VIL... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
HEK293,
HeLa,
hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278805 | 45 |
TTG... |
LMA... |
TTG |
ncRNA sORF |
LCL, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
525000 | 63 |
GTG... |
VSA... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
HEK293,
HeLa,
hES, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304045 | 69 |
CTG... |
LDC... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278811 | 36 |
ATG... |
MME... |
ATG |
ncRNA sORF |
BJ,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278797 | 171 |
ATG... |
MFS... |
ATG |
Alternative NMD sORF Upstream |
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1129607 | 219 |
CTG... |
LSN... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1720004 | 39 |
GTG... |
VVK... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98966 | 90 |
CTG... |
LQE... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293,
HeLa,
hES
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304008 | 48 |
CTG... |
LSW... |
CTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278830 | 33 |
CTG... |
LRA... |
CTG |
ncRNA sORF |
HeLa,
LCL,
MDA-MB-231,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278799 | 33 |
TTG... |
LYN... |
TTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Blood,
HeLa,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2953104 | 126 |
GTG... |
VSP... |
GTG |
InCDS NMD Overlapping sORF |
hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1720506 | 45 |
ATG... |
MTC... |
ATG |
Downstream NMD sORF InCDS Overlapping |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, Blood, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98938 | 138 |
CTG... |
LTG... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899666 | 63 |
AAT... |
NDG... |
AAT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899659 | 69 |
GTT... |
VGI... |
GTT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278832 | 51 |
CTG... |
LFS... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278813 | 33 |
ATG... |
MEL... |
ATG |
ncRNA sORF |
BJ,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98929 | 177 |
CTG... |
LPS... |
CTG |
NMD Overlapping sORF Upstream |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2953106 | 105 |
GTG... |
VSF... |
GTG |
InCDS NMD Overlapping sORF |
hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278789 | 39 |
CTG... |
LLM... |
CTG |
Alternative NMD sORF Upstream |
HEK293,
HeLa,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
631877 | 69 |
TTG... |
LFS... |
TTG |
ncRNA sORF |
THP-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1134687 | 87 |
GTG... |
VID... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293, RPE-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278784 | 51 |
CTG... |
LAR... |
CTG |
ncRNA sORF |
HAP1,
HEK293,
HEK293T,
LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2303984 | 75 |
ATG... |
MIA... |
ATG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98956 | 150 |
GTG... |
VTF... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278801 | 30 |
CTG... |
LSM... |
CTG |
InCDS NMD Overlapping sORF |
LCL, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304004 | 60 |
GTG... |
VST... |
GTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2303972 | 126 |
TTG... |
LLS... |
TTG |
Alternative NMD sORF Upstream |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1129611 | 189 |
GTG... |
VLC... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
438 | 111 |
TTG... |
LLC... |
TTG |
Intronic sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98940 | 129 |
CTG... |
LLS... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2303958 | 36 |
TTG... |
LIP... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2540380 | 42 |
ATG... |
MNF... |
ATG |
ncRNA sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1129609 | 207 |
CTG... |
LDI... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1983965 | 36 |
ATG... |
MVY... |
ATG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
HeLa,
MDA-MB-231,
RPE-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1720011 | 57 |
CTG... |
LLL... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
hES,
HFF,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1719994 | 51 |
CTG... |
LEC... |
CTG |
NMD sORF Upstream |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278822 | 129 |
GTG... |
VDW... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278793 | 33 |
ATG... |
MSM... |
ATG |
Alternative NMD sORF Upstream |
HEK293,
HeLa,
hES,
LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278795 | 33 |
CTG... |
LGC... |
CTG |
Alternative NMD sORF Upstream |
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1134685 | 93 |
GTG... |
VVV... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293, RPE-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3014859 | 57 |
CTG... |
LGL... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
MM1S | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2303986 | 78 |
TTG... |
LPS... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
445 | 57 |
CTG... |
LVL... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
hES,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
631875 | 30 |
TTG... |
LQR... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood, THP-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1983968 | 141 |
GTG... |
VTK... |
GTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2303978 | 90 |
ATG... |
MPT... |
ATG |
Alternative NMD sORF Upstream |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1720020 | 36 |
GTG... |
VQI... |
GTG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Export data