Gene
Gene
ID CARD
ID
HGNC:1919
Aliases
CHD4
ENSG00000111642,
HGNC:1919,
Mi-2b
Mi2-BETA,
NCBI:1108,
OFF:CHD4
Chromosome
12
Transcripts
346 ORFs
24 known transcripts
364 ORF to known transcript associations
|
MetamORF transcript ID The MetamORF ID of the transcript. This is an arbitrary ID that does not correspond to any official (Ensembl, NCBI...) transcript ID or external reference. |
Transcript ID
The official transcript ID (usually an Ensembl ID, e.g. ENST00000395565). |
Transcript name
The transcript name (e.g. MDK-202). |
Transcript biotype
The biotype of the transcript (as defined by Ensembl). |
ORFs
Display all the transcripts related to the entry. |
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| 9874 | ENST00000646070 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 9866 | ENST00000646145 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 296910 | ENST00000644132 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 9928 | ENST00000646366 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 15111 | ENST00000647112 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 9913 | ENST00000644356 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 1095250 | ENST00000644801 | nonsense_mediated_decay | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 3325952 | UNKNOWN_TRANSCRIPT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 9850 | ENST00000643367 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 308631 | ENST00000644289 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 9859 | ENST00000646609 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 9893 | ENST00000537634 | CHD4-207 | retained_intron | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 308654 | ENST00000545942 | CHD4-214 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 308626 | ENST00000645005 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 9898 | ENST00000545083 | CHD4-212 | retained_intron | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 1140220 | ENST00000645199 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 4345907 | ENST00000357008 | CHD4-201 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 106284 | ENST00000545584 | CHD4-213 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 9837 | ENST00000642893 | nonsense_mediated_decay | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 9869 | ENST00000647333 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 106216 | ENST00000540960 | CHD4-208 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 1521410 | ENST00000646806 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 484242 | ENST00000645717 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 14770 | ENST00000645143 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 1826588 | ENST00000535717 | CHD4-203 | retained_intron | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ORFs
346 ORFs
24 known transcripts
364 ORF to known transcript associations
|
MetamORF ORF ID The MetamORF ID of the ORF. This is an unique ID referring to the ORF. |
ORF Length
The genomic length of the ORF (in bp). This length is defined as the sum of the lengths of each exon constituting the ORF (thus excluding its eventual introns) and includes both the start and the stop codons. |
Nucleic sequence The nucleic sequence of the ORF. |
Amino acid sequence The amino acid sequence of the ORF. |
Start codon
The start codon sequence of the ORF. |
ORF annotations
A comma-separated list of all the annotations computed by our algorithm for the ORF. This list includes the annotations computed for the ORF for all transcripts. See the section dedicated to ORF annotations in the advanced documentation for more details regarding the nomenclature we use. |
Cell types
A comma-separated list of all the cell types in which the ORF has already been identified. |
Transcripts
Display all the transcripts related to the entry. |
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| 918875 | 129 |
TTC... |
FLL... |
TTC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296837 | 102 |
CTG... |
LTF... |
CTG |
Intronic sORF |
hES,
LCL,
U2OS
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484290 | 126 |
GTG... |
VTR... |
GTG |
sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1514029 | 39 |
GTG... |
VRK... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9873 | 33 |
CTG... |
LTG... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15127 | 93 |
GTG... |
VRL... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3201426 | 75 |
CCA... |
PPQ... |
CCA |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9895 | 123 |
CTG... |
LLE... |
CTG |
NMD sORF Intronic |
HEK293,
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484277 | 96 |
ATG... |
MWV... |
ATG |
sORF Intronic Alternative InCDS Overlapping |
Blood,
HAP1,
HEK293T, Brain_tumor, HEK293, HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639542 | 39 |
GTG... |
VGS... |
GTG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918842 | 171 |
GAA... |
EEL... |
GAA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308641 | 39 |
GTG... |
VNG... |
GTG |
sORF |
Blood,
HEK293T,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296841 | 60 |
ATG... |
MKR... |
ATG |
Intronic sORF InCDS Overlapping |
LCL,
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15129 | 162 |
CTG... |
LLS... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918858 | 231 |
CAA... |
QAL... |
CAA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918878 | 117 |
GAG... |
EDF... |
GAG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3228538 | 165 |
CTG... |
LWM... |
CTG |
ncRNA sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1733954 | 54 |
TTG... |
LGK... |
TTG |
Intronic sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1733965 | 39 |
TTG... |
LQR... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918919 | 252 |
AAG... |
KND... |
AAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9938 | 90 |
CTG... |
LDL... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
MDA-MB-231,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2331463 | 42 |
TTG... |
LIG... |
TTG |
Intronic sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296890 | 111 |
ATG... |
MSH... |
ATG |
ncRNA sORF |
BJ, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9861 | 222 |
GTG... |
VIE... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 14774 | 171 |
CTG... |
LTP... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296855 | 66 |
ATG... |
MIS... |
ATG |
ncRNA sORF |
Blood, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2331422 | 69 |
CTG... |
LMV... |
CTG |
Intronic sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484272 | 75 |
GTG... |
VPS... |
GTG |
Intronic sORF |
Blood, HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296843 | 78 |
CTG... |
LPL... |
CTG |
Intronic sORF |
LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1050235 | 39 |
TTG... |
LLP... |
TTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1299128 | 108 |
GTG... |
VRS... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293T, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918952 | 69 |
TCC... |
SQD... |
TCC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9886 | 87 |
CTG... |
LGA... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1521407 | 168 |
GTG... |
VTP... |
GTG |
sORF |
BJ, loayza_puch_2016 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918909 | 252 |
TAT... |
YER... |
TAT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1826595 | 114 |
CTG... |
LSL... |
CTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 410223 | 84 |
TAC... |
YDQ... |
TAC |
ncRNA sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 708452 | 234 |
TCC... |
SKE... |
TCC |
ncRNA sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 452067 | 54 |
CTG... |
LAN... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9849 | 120 |
TTG... |
LAE... |
TTG |
ncRNA sORF |
Brain,
guo_2014,
HAP1,
HEK293, HEK293T, hES, HFF, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106220 | 153 |
CTG... |
LGS... |
CTG |
ncRNA sORF |
guo_2014,
HEK293,
HFF
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1833983 | 132 |
TTG... |
LMI... |
TTG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296853 | 51 |
TTG... |
LAL... |
TTG |
ncRNA sORF |
LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918949 | 207 |
GGT... |
GEE... |
GGT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296835 | 75 |
ATG... |
MKS... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918947 | 171 |
GAA... |
EEE... |
GAA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918905 | 240 |
CCA... |
PEY... |
CCA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 535973 | 30 |
TTG... |
LVP... |
TTG |
sORF |
HEK293,
hES,
U2OS
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308625 | 117 |
TTG... |
LQM... |
TTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9923 | 231 |
CTG... |
LDA... |
CTG |
Intronic sORF |
Brain,
guo_2014,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, HFF, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15121 | 180 |
CTG... |
LKQ... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308666 | 246 |
TTG... |
LDL... |
TTG |
sORF |
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 707966 | 114 |
ACC... |
TTC... |
ACC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9892 | 108 |
TTG... |
LEH... |
TTG |
Intronic sORF NMD |
BJ,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, Jurkat, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918888 | 141 |
GCC... |
AKE... |
GCC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 708458 | 228 |
GAG... |
ESM... |
GAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9904 | 105 |
CTG... |
LGP... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918962 | 45 |
GGA... |
GCT... |
GGA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 410217 | 240 |
TTT... |
FVT... |
TTT |
ncRNA sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9863 | 225 |
CTG... |
LVI... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 410229 | 201 |
GAG... |
EIL... |
GAG |
ncRNA sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918901 | 57 |
CCC... |
PLS... |
CCC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918929 | 129 |
GCT... |
ADP... |
GCT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 451926 | 165 |
ATG... |
MMR... |
ATG |
sORF Alternative InCDS Overlapping |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa, HFF, Blood, HEK293T |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106206 | 99 |
CTG... |
LSK... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HFF,
Brain,
guo_2014, hES |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9910 | 174 |
TTG... |
LEG... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639565 | 42 |
ATG... |
MAR... |
ATG |
ncRNA sORF Alternative InCDS Overlapping |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, MM1S, THP-1, Brain_tumor, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918960 | 66 |
AGA... |
RGP... |
AGA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2345587 | 87 |
ATG... |
MRW... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308658 | 177 |
ATG... |
MIQ... |
ATG |
sORF |
Blood,
HEK293T,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9880 | 60 |
CTG... |
LLT... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9919 | 114 |
TTG... |
LNG... |
TTG |
Intronic sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, Jurkat, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296831 | 84 |
GTG... |
VFG... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
guo_2014,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 535984 | 216 |
GTG... |
VWG... |
GTG |
sORF |
guo_2014, U2OS | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1601753 | 87 |
ATG... |
MLV... |
ATG |
Intronic sORF |
Flp-In_T-REx-293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308645 | 84 |
CTG... |
LMV... |
CTG |
sORF |
HEK293T,
HeLa,
LCL
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9942 | 288 |
CTG... |
LHC... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106283 | 123 |
ATG... |
MKR... |
ATG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 707960 | 288 |
CAA... |
QNK... |
CAA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2345585 | 75 |
TTG... |
LGK... |
TTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918941 | 183 |
ATC... |
IWK... |
ATC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918844 | 102 |
CAC... |
HLS... |
CAC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308649 | 132 |
ATG... |
MWN... |
ATG |
sORF Alternative InCDS Overlapping |
HeLa,
LCL,
Brain_tumor, HEK293, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2345583 | 66 |
CTG... |
LYR... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3201433 | 174 |
CCA... |
PDM... |
CCA |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1833981 | 129 |
ATG... |
MIS... |
ATG |
sORF InCDS Overlapping |
HeLa,
Brain_tumor,
HEK293, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296869 | 102 |
CTG... |
LGN... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293T,
LCL
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484244 | 78 |
ATG... |
MAM... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF Intronic |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, HEK293T, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308670 | 291 |
GTG... |
VRA... |
GTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639555 | 45 |
ATG... |
MLQ... |
ATG |
Intronic sORF |
HAP1,
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 410221 | 75 |
GCT... |
ASW... |
GCT |
ncRNA sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918893 | 63 |
ACA... |
TWL... |
ACA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106278 | 96 |
GTG... |
VSS... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9839 | 141 |
GTG... |
VTR... |
GTG |
NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2331424 | 72 |
TTG... |
LLM... |
TTG |
Intronic sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918921 | 258 |
CAG... |
QRK... |
CAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296861 | 111 |
CTG... |
LGW... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HAP1,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296882 | 30 |
TTG... |
LLT... |
TTG |
Intronic sORF |
HAP1,
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1514042 | 90 |
TTG... |
LVV... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ, Blood | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1733938 | 78 |
ATG... |
MTC... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF Intronic |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, Blood, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296877 | 36 |
ATG... |
MCS... |
ATG |
Intronic sORF |
HeLa,
hES,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9868 | 33 |
ATG... |
MRL... |
ATG |
Intronic sORF InCDS Overlapping |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS, Brain_tumor, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484283 | 60 |
ATG... |
MWR... |
ATG |
ncRNA sORF |
HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15125 | 159 |
CTG... |
LSD... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9936 | 84 |
TTG... |
LQC... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9888 | 126 |
TTG... |
LLS... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106232 | 237 |
GTG... |
VTR... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, Jurkat, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639533 | 54 |
CTG... |
LEE... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1209536 | 33 |
ATG... |
MVT... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF Intronic |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, Blood, HAP1, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1826613 | 96 |
ATG... |
MTT... |
ATG |
ncRNA sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308635 | 126 |
CTG... |
LGA... |
CTG |
sORF |
HEK293,
HeLa,
LCL
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9856 | 207 |
CTG... |
LRR... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296909 | 30 |
GTG... |
VRR... |
GTG |
sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
HeLa, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9843 | 165 |
CTG... |
LLS... |
CTG |
NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 707962 | 69 |
ACC... |
TSS... |
ACC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 707968 | 123 |
AAG... |
KTL... |
AAG |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918846 | 108 |
CAT... |
HQH... |
CAT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9952 | 114 |
CTG... |
LLC... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2427914 | 72 |
GTG... |
VAQ... |
GTG |
Intronic sORF |
hES, HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9847 | 183 |
CTG... |
LKQ... |
CTG |
NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308668 | 270 |
CTG... |
LAR... |
CTG |
sORF |
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1733912 | 30 |
CTG... |
LGE... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296895 | 114 |
TTG... |
LSL... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1833979 | 114 |
TTG... |
LAL... |
TTG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484260 | 54 |
GTG... |
VGI... |
GTG |
Intronic sORF |
HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1213178 | 45 |
TTG... |
LVP... |
TTG |
sORF |
HAP1,
HEK293,
HEK293T,
MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9934 | 135 |
GTG... |
VDK... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1521409 | 225 |
CTG... |
LEP... |
CTG |
sORF |
BJ | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639518 | 36 |
ATG... |
MPE... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF Intronic |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, BJ, Blood, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106272 | 99 |
TTG... |
LEG... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HEK293, hES |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484248 | 108 |
TTG... |
LFF... |
TTG |
Intronic sORF |
HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296847 | 30 |
ATG... |
MWY... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
HEK293,
hES,
LCL, loayza_puch_2016, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1140228 | 210 |
CTG... |
LAE... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106215 | 60 |
TTG... |
LAG... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HEK293T, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918943 | 156 |
CAC... |
HHM... |
CAC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296845 | 60 |
ATG... |
MIK... |
ATG |
Intronic sORF |
LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918852 | 144 |
ACC... |
TRF... |
ACC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308643 | 81 |
ATG... |
MVP... |
ATG |
sORF |
HeLa, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9921 | 210 |
CTG... |
LHP... |
CTG |
Intronic sORF |
guo_2014,
HAP1,
HEK293,
HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9890 | 123 |
GTG... |
VLS... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, LCL, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2345579 | 54 |
CTG... |
LQW... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1514038 | 84 |
GTG... |
VMK... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 451924 | 162 |
ATG... |
MRN... |
ATG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
HeLa |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918945 | 165 |
GAG... |
EDD... |
GAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484226 | 57 |
CTG... |
LAN... |
CTG |
NMD sORF |
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, hES, HFF, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1514044 | 99 |
CTG... |
LGT... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ, Blood | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1733902 | 39 |
CTG... |
LAA... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9865 | 39 |
ATG... |
MRS... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2345589 | 90 |
CTG... |
LMR... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2331501 | 39 |
GTG... |
VYL... |
GTG |
sORF |
hES, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 535978 | 177 |
GTG... |
VFL... |
GTG |
sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
HeLa, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639539 | 45 |
TTG... |
LKT... |
TTG |
Intronic sORF |
THP-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1097705 | 108 |
CTG... |
LRN... |
CTG |
sORF |
HEK293,
HeLa,
RPE-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3201424 | 63 |
GCT... |
AFT... |
GCT |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296912 | 93 |
CTG... |
LAG... |
CTG |
sORF |
BJ,
guo_2014,
HAP1,
HEK293, HeLa, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9876 | 39 |
ATG... |
MTL... |
ATG |
ncRNA sORF |
HAP1,
HEK293,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918860 | 30 |
CTA... |
LCP... |
CTA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918956 | 30 |
TCC... |
SKA... |
TCC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296873 | 105 |
CTG... |
LSF... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood,
LCL,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106224 | 168 |
GTG... |
VVR... |
GTG |
ncRNA sORF |
guo_2014,
HEK293,
HFF
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9897 | 33 |
GTG... |
VRV... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296857 | 69 |
TTG... |
LMI... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2331440 | 48 |
GTG... |
VRQ... |
GTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 942177 | 84 |
CTG... |
LRN... |
CTG |
Intronic sORF |
Brain,
HAP1,
HFF
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918854 | 165 |
CAC... |
HPS... |
CAC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1514040 | 87 |
GTG... |
VVM... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ, Blood | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106255 | 177 |
TTG... |
LRF... |
TTG |
Intronic sORF |
guo_2014, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308633 | 174 |
CTG... |
LGW... |
CTG |
sORF |
LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 410219 | 159 |
GAG... |
EEF... |
GAG |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106270 | 69 |
GTG... |
VKW... |
GTG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9845 | 174 |
CTG... |
LEE... |
CTG |
NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1995843 | 33 |
TTG... |
LQM... |
TTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918899 | 48 |
AAT... |
NGG... |
AAT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106251 | 231 |
GTG... |
VSA... |
GTG |
Intronic sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, hES, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 14776 | 195 |
GTG... |
VEE... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308664 | 186 |
ATG... |
MMM... |
ATG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9930 | 42 |
GTG... |
VAG... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
hES,
LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1299126 | 93 |
GTG... |
VIP... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293T, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15123 | 258 |
TTG... |
LAE... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1833992 | 162 |
GTG... |
VLS... |
GTG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1209513 | 66 |
GTG... |
VWI... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9932 | 108 |
TTG... |
LIK... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 708456 | 282 |
ACC... |
TRF... |
ACC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9852 | 129 |
GTG... |
VEC... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293T, HeLa, hES, HFF, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918937 | 162 |
CCA... |
PSP... |
CCA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9900 | 69 |
GTG... |
VFK... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296897 | 30 |
ATG... |
MAL... |
ATG |
ncRNA sORF |
BJ,
HeLa,
LCL,
MM1S |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1209511 | 57 |
CTG... |
LTT... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3325957 | 377 |
ATG... |
MAS... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106265 | 33 |
GTG... |
VWT... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308656 | 153 |
CTG... |
LLS... |
CTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15113 | 138 |
GTG... |
VTR... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1514036 | 81 |
ATG... |
MKR... |
ATG |
ncRNA sORF |
BJ, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918871 | 267 |
CAA... |
QNK... |
CAA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2345576 | 78 |
ATG... |
MTL... |
ATG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2331420 | 66 |
ATG... |
MVS... |
ATG |
Intronic sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106249 | 150 |
GTG... |
VGD... |
GTG |
Intronic sORF |
HEK293, HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308653 | 117 |
TTG... |
LTT... |
TTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 14772 | 159 |
GTG... |
VVE... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918897 | 249 |
TCC... |
SKG... |
TCC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2345591 | 105 |
CTG... |
LTP... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296903 | 33 |
CTG... |
LQG... |
CTG |
ncRNA sORF |
LCL, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9908 | 162 |
TTG... |
LEE... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2331465 | 66 |
TTG... |
LTW... |
TTG |
Intronic sORF |
HeLa, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296905 | 42 |
CTG... |
LSG... |
CTG |
ncRNA sORF |
LCL, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106274 | 147 |
GTG... |
VPR... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, hES, HFF, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9854 | 189 |
TTG... |
LNM... |
TTG |
ncRNA sORF |
Jurkat,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1052633 | 54 |
TTG... |
LSD... |
TTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484241 | 72 |
ATG... |
MPG... |
ATG |
Intronic sORF |
HAP1,
HEK293T,
HeLa,
hES, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 451919 | 96 |
CTG... |
LRW... |
CTG |
sORF |
HEK293T, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 410215 | 36 |
GAC... |
DLR... |
GAC |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296899 | 30 |
GTG... |
VNG... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293T,
HeLa,
LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1733900 | 48 |
ATG... |
MTH... |
ATG |
Intronic sORF |
Blood,
hES,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918850 | 78 |
GGC... |
GGK... |
GGC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639544 | 45 |
CTG... |
LYR... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293,
MDA-MB-231,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1733972 | 51 |
GTG... |
VGS... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2345574 | 72 |
CTG... |
LTG... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639510 | 33 |
CTG... |
LRG... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
HeLa,
hES,
THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308639 | 81 |
CTG... |
LGN... |
CTG |
sORF |
Blood,
HEK293T,
LCL
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9954 | 195 |
CTG... |
LEE... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484246 | 99 |
CTG... |
LST... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293,
HEK293T,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296892 | 120 |
ATG... |
MIW... |
ATG |
ncRNA sORF InCDS Overlapping |
BJ,
LCL,
Brain_tumor, HEK293, HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2331497 | 30 |
ATG... |
MPR... |
ATG |
sORF |
hES, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918868 | 114 |
CGA... |
RKA... |
CGA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639529 | 36 |
CTG... |
LLN... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3325954 | 1062 |
ATG... |
MAS... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1299123 | 60 |
ATG... |
MVG... |
ATG |
ncRNA sORF |
HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918873 | 123 |
CTT... |
LST... |
CTT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 708450 | 240 |
CAC... |
HLS... |
CAC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918848 | 72 |
AAG... |
KSS... |
AAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 14769 | 36 |
ATG... |
MQS... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106228 | 201 |
GTG... |
VAK... |
GTG |
ncRNA sORF |
guo_2014,
HEK293,
HeLa,
hES, HFF, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9884 | 78 |
TTG... |
LES... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 942198 | 39 |
CTG... |
LSG... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HEK293, HEK293T, HeLa, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484292 | 153 |
CTG... |
LCF... |
CTG |
sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, HeLa, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918931 | 138 |
CCT... |
PPD... |
CCT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3201431 | 93 |
TGG... |
WVT... |
TGG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1010666 | 120 |
CTG... |
LLQ... |
CTG |
Intronic sORF |
guo_2014, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918954 | 75 |
CAA... |
QKS... |
CAA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1300603 | 111 |
ATG... |
MPV... |
ATG |
sORF |
HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484280 | 33 |
TTG... |
LVA... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
HEK293T, HeLa, MDA-MB-231, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296859 | 93 |
CTG... |
LDL... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HAP1,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106281 | 150 |
GTG... |
VES... |
GTG |
ncRNA sORF |
Flp-In_T-REx-293,
HEK293,
HFF
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 708454 | 246 |
CAT... |
HQH... |
CAT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106222 | 165 |
GTG... |
VRP... |
GTG |
ncRNA sORF |
guo_2014,
HEK293,
HFF
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9882 | 90 |
CTG... |
LAT... |
CTG |
ncRNA sORF |
guo_2014,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639531 | 45 |
TTG... |
LFH... |
TTG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308637 | 33 |
GTG... |
VGI... |
GTG |
sORF |
Blood,
HEK293T,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2331408 | 36 |
ATG... |
MPS... |
ATG |
Intronic sORF |
hES, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3228536 | 159 |
ATG... |
MVM... |
ATG |
ncRNA sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 707970 | 210 |
GGA... |
GRR... |
GGA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3228540 | 168 |
CTG... |
LLW... |
CTG |
ncRNA sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3228534 | 153 |
ATG... |
MRQ... |
ATG |
ncRNA sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918939 | 171 |
GGT... |
GQP... |
GGT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 451939 | 141 |
CTG... |
LRR... |
CTG |
sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, HeLa, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639568 | 57 |
CTG... |
LEV... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918907 | 246 |
CGA... |
RQP... |
CGA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1209506 | 33 |
ATG... |
MSL... |
ATG |
Intronic sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15117 | 192 |
CTG... |
LHK... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3228511 | 96 |
TTG... |
LVL... |
TTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918933 | 144 |
CCT... |
PRP... |
CCT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 707958 | 183 |
TCA... |
SAI... |
TCA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639546 | 66 |
ATG... |
MRW... |
ATG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293T,
MDA-MB-231,
THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484256 | 42 |
GTG... |
VLS... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HEK293T,
HeLa |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639548 | 69 |
CTG... |
LMR... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293T,
MDA-MB-231,
THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 708460 | 144 |
GCT... |
ADV... |
GCT |
ncRNA sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639553 | 36 |
GTG... |
VEP... |
GTG |
Intronic sORF |
HAP1,
HEK293,
MDA-MB-231,
THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1095234 | 78 |
ATG... |
MRN... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2345568 | 129 |
CTG... |
LRW... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2345581 | 60 |
CTG... |
LWL... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9858 | 33 |
TTG... |
LRN... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296871 | 48 |
TTG... |
LKH... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
hES,
LCL, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106230 | 222 |
GTG... |
VEE... |
GTG |
ncRNA sORF |
guo_2014,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, hES, HFF, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 707964 | 93 |
ATT... |
IIE... |
ATT |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639557 | 69 |
ATG... |
MSD... |
ATG |
Intronic sORF Alternative InCDS Overlapping |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, THP-1, Brain_tumor, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2345572 | 156 |
ATG... |
MGA... |
ATG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308630 | 156 |
CTG... |
LDL... |
CTG |
sORF |
LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3201429 | 72 |
CCA... |
PSS... |
CCA |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9948 | 210 |
CTG... |
LKG... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, hES, HFF, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1140268 | 33 |
CTG... |
LFK... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484294 | 162 |
CTG... |
LTV... |
CTG |
sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, HeLa, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918923 | 264 |
AAC... |
NYQ... |
AAC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918964 | 120 |
GCC... |
AGR... |
GCC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9902 | 90 |
TTG... |
LRR... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308662 | 183 |
ATG... |
MMM... |
ATG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9925 | 258 |
GTG... |
VKY... |
GTG |
Intronic sORF |
Brain,
guo_2014,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2345566 | 33 |
CTG... |
LHL... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296839 | 108 |
CTG... |
LEL... |
CTG |
Intronic sORF |
hES,
LCL,
U2OS
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918882 | 66 |
TGG... |
WQC... |
TGG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2331418 | 63 |
GTG... |
VSP... |
GTG |
Intronic sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9940 | 276 |
GTG... |
VMF... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106226 | 180 |
CTG... |
LTH... |
CTG |
ncRNA sORF |
guo_2014,
HEK293,
hES,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2055986 | 87 |
GTG... |
VQN... |
GTG |
sORF |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 451921 | 99 |
TTG... |
LLR... |
TTG |
sORF |
HAP1,
HEK293T,
HeLa
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 535982 | 198 |
GTG... |
VRV... |
GTG |
sORF |
guo_2014,
HeLa,
U2OS
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2331467 | 33 |
TTG... |
LKC... |
TTG |
Intronic sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1601751 | 60 |
ATG... |
MQL... |
ATG |
Intronic sORF |
Flp-In_T-REx-293,
HeLa,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9871 | 147 |
CTG... |
LLD... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, LCL, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1010668 | 123 |
TTG... |
LLL... |
TTG |
Intronic sORF |
guo_2014, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9915 | 84 |
TTG... |
LLT... |
TTG |
Intronic sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15110 | 267 |
GTG... |
VEC... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9878 | 57 |
CTG... |
LTQ... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1050233 | 36 |
CTG... |
LPK... |
CTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918925 | 291 |
GAG... |
ELH... |
GAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1095236 | 81 |
ATG... |
MMR... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2345570 | 138 |
CTG... |
LNW... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9950 | 69 |
CTG... |
LNP... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296886 | 39 |
CTG... |
LKQ... |
CTG |
Intronic sORF |
guo_2014, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 451937 | 150 |
CTG... |
LPP... |
CTG |
sORF |
BJ, HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918958 | 102 |
ATT... |
ICQ... |
ATT |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1010709 | 219 |
CTG... |
LGW... |
CTG |
sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9927 | 54 |
GTG... |
VEI... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484274 | 90 |
GTG... |
VTR... |
GTG |
Intronic sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293T
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 708462 | 168 |
GAA... |
EEL... |
GAA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9912 | 81 |
CTG... |
LTG... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308660 | 180 |
ATG... |
MMI... |
ATG |
sORF |
Blood,
HEK293T,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2427916 | 87 |
TTG... |
LSS... |
TTG |
Intronic sORF |
hES, HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9906 | 117 |
CTG... |
LHD... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1209508 | 45 |
ATG... |
MVC... |
ATG |
Intronic sORF |
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9836 | 96 |
GTG... |
VRL... |
GTG |
NMD sORF |
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106257 | 186 |
CTG... |
LNW... |
CTG |
Intronic sORF |
guo_2014,
HAP1,
HEK293
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 484270 | 57 |
ATG... |
MSS... |
ATG |
Intronic sORF |
HEK293,
HEK293T,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9944 | 294 |
CTG... |
LEL... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9946 | 198 |
GTG... |
VQK... |
GTG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, hES, HFF, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 639550 | 84 |
CTG... |
LTP... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood,
HEK293T,
HeLa,
MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1833987 | 99 |
CTG... |
LLT... |
CTG |
sORF |
HEK293, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918903 | 228 |
GAT... |
DAT... |
GAT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1826587 | 54 |
CTG... |
LLH... |
CTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 106253 | 141 |
TTG... |
LAD... |
TTG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918913 | 48 |
ATC... |
IQD... |
ATC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15119 | 237 |
CTG... |
LSK... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1833989 | 117 |
TTG... |
LES... |
TTG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1826597 | 129 |
CTG... |
LSY... |
CTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15115 | 171 |
CTG... |
LEE... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1010664 | 117 |
CTG... |
LQK... |
CTG |
Intronic sORF |
guo_2014, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 918935 | 30 |
CAC... |
HTS... |
CAC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9917 | 87 |
CTG... |
LLL... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 308647 | 90 |
CTG... |
LFL... |
CTG |
sORF |
HEK293T, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 296849 | 108 |
TTG... |
LQG... |
TTG |
Intronic sORF |
guo_2014,
HEK293,
HeLa,
hES, HFF, LCL, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1733926 | 57 |
CTG... |
LLL... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1826593 | 114 |
CTG... |
LAG... |
CTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9841 | 162 |
CTG... |
LSD... |
CTG |
NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 942175 | 60 |
TTG... |
LPP... |
TTG |
Intronic sORF |
Brain | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2331499 | 33 |
CTG... |
LMP... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 410225 | 213 |
GGT... |
GDE... |
GGT |
ncRNA sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1833985 | 96 |
CTG... |
LTQ... |
CTG |
sORF |
HEK293, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Export data