Gene
Gene
ID CARD
ID
HGNC:10705
Aliases
ENSG00000176986
HGNC:10705,
KIAA0079,
NCBI:9632
OFF:SEC24C,
SEC24C
Chromosome
10
Transcripts
226 ORFs
6 known transcripts
233 ORF to known transcript associations
MetamORF transcript ID The MetamORF ID of the transcript. This is an arbitrary ID that does not correspond to any official (Ensembl, NCBI...) transcript ID or external reference. |
Transcript ID
The official transcript ID (usually an Ensembl ID, e.g. ENST00000395565). |
Transcript name
The transcript name (e.g. MDK-202). |
Transcript biotype
The biotype of the transcript (as defined by Ensembl). |
ORFs
Display all the transcripts related to the entry. |
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95467 | ENST00000634508 | SEC24C-206 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1368 | ENST00000496827 | SEC24C-205 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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280896 | ENST00000477008 | SEC24C-204 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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95462 | ENST00000635550 | SEC24C-207 | nonsense_mediated_decay | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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525757 | ENST00000345254 | SEC24C-202 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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280909 | ENST00000339365 | SEC24C-201 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3299537 | UNKNOWN_TRANSCRIPT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
ORFs
226 ORFs
6 known transcripts
233 ORF to known transcript associations
MetamORF ORF ID The MetamORF ID of the ORF. This is an unique ID referring to the ORF. |
ORF Length
The genomic length of the ORF (in bp). This length is defined as the sum of the lengths of each exon constituting the ORF (thus excluding its eventual introns) and includes both the start and the stop codons. |
Nucleic sequence The nucleic sequence of the ORF. |
Amino acid sequence The amino acid sequence of the ORF. |
Start codon
The start codon sequence of the ORF. |
ORF annotations
A comma-separated list of all the annotations computed by our algorithm for the ORF. This list includes the annotations computed for the ORF for all transcripts. See the section dedicated to ORF annotations in the advanced documentation for more details regarding the nomenclature we use. |
Cell types
A comma-separated list of all the cell types in which the ORF has already been identified. |
Transcripts
Display all the transcripts related to the entry. |
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2298642 | 66 |
CTG... |
LPH... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231, RPE-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95489 | 111 |
GTG... |
VKA... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280902 | 57 |
ATG... |
MYR... |
ATG |
ncRNA sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
275455 | 45 |
CTG... |
LVH... |
CTG |
sORF |
LCL, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896375 | 174 |
CAG... |
QPF... |
CAG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1203952 | 102 |
ATG... |
MWM... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, Blood, HAP1, MDA-MB-231, |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1203949 | 153 |
TTG... |
LAV... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280923 | 90 |
CTG... |
LFV... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95469 | 75 |
TTG... |
LAV... |
TTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1721535 | 126 |
ATG... |
MGI... |
ATG |
InCDS Overlapping sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, Blood, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896369 | 75 |
GAG... |
EMY... |
GAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901591 | 60 |
GAG... |
EMY... |
GAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280900 | 69 |
TTG... |
LAK... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
523596 | 57 |
CTG... |
LLD... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1816482 | 57 |
ATG... |
MPS... |
ATG |
Downstream NMD sORF InCDS Overlapping |
HeLa,
Brain_tumor,
HEK293,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
934026 | 99 |
CTG... |
LAD... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
HEK293,
HFF
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901577 | 258 |
CAA... |
QSG... |
CAA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97496 | 111 |
TTG... |
LAQ... |
TTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896403 | 126 |
GCT... |
AEV... |
GCT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
934024 | 117 |
CTG... |
LNC... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
404625 | 138 |
GAT... |
DGD... |
GAT |
ncRNA sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896383 | 204 |
TTC... |
FRG... |
TTC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896401 | 147 |
AGT... |
SDV... |
AGT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95497 | 99 |
CTG... |
LPV... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
404627 | 159 |
TGT... |
CVL... |
TGT |
ncRNA sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95491 | 66 |
CTG... |
LAC... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HeLa, HFF, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1721513 | 162 |
CTG... |
LTC... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1816484 | 45 |
CTG... |
LVL... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718228 | 36 |
TTG... |
LIA... |
TTG |
Downstream NMD sORF |
Blood,
HeLa,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1721539 | 57 |
GTG... |
VLS... |
GTG |
InCDS Overlapping sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896363 | 90 |
GGC... |
GCI... |
GGC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97484 | 66 |
CTG... |
LAA... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
Brain,
HEK293,
hES,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
523585 | 99 |
TTG... |
LWP... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95481 | 84 |
CTG... |
LSD... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95466 | 105 |
ATG... |
MEA... |
ATG |
sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231,
THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1816470 | 45 |
ATG... |
MCL... |
ATG |
InCDS Overlapping sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896329 | 264 |
CCA... |
PVS... |
CCA |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1046326 | 156 |
CTG... |
LPI... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95483 | 75 |
CTG... |
LRR... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896353 | 135 |
AGT... |
STR... |
AGT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1816478 | 84 |
CTG... |
LGS... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718173 | 162 |
CTG... |
LTR... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Blood | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
523598 | 54 |
CTG... |
LDG... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280917 | 153 |
TTG... |
LCH... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896337 | 237 |
TGG... |
WAA... |
TGG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896398 | 105 |
GCT... |
AVR... |
GCT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896394 | 159 |
TTT... |
FVT... |
TTT |
Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280906 | 33 |
CTG... |
LFR... |
CTG |
ncRNA sORF |
HeLa, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95479 | 108 |
GTG... |
VEN... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97474 | 186 |
CTG... |
LPG... |
CTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
HEK293,
hES,
HFF,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280929 | 30 |
GTG... |
VLA... |
GTG |
InCDS Overlapping sORF |
HAP1,
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896381 | 210 |
CCC... |
PSF... |
CCC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901571 | 282 |
TAT... |
YHQ... |
TAT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718224 | 72 |
TTG... |
LSR... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
hES,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
630676 | 114 |
GTG... |
VGN... |
GTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231, THP-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1816476 | 42 |
CTG... |
LSY... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HeLa,
MDA-MB-231,
RPE-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718182 | 45 |
TTG... |
LAL... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Blood | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1046328 | 129 |
CTG... |
LKN... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2298631 | 162 |
TTG... |
LGS... |
TTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95507 | 105 |
CTG... |
LFK... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896341 | 138 |
TAT... |
YHQ... |
TAT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3299542 | 3129 |
ATG... |
MNV... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896351 | 141 |
TGG... |
WPS... |
TGG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
404629 | 135 |
CAG... |
QPG... |
CAG |
ncRNA sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3069345 | 81 |
CTG... |
LGA... |
CTG |
Alternative sORF Upstream |
MM1S | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97488 | 36 |
CTG... |
LPP... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896405 | 105 |
CGT... |
RAY... |
CGT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280927 | 63 |
GTG... |
VPR... |
GTG |
InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
275459 | 129 |
ATG... |
MQV... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
Jurkat, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2298645 | 30 |
CTG... |
LDR... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896355 | 126 |
CCA... |
PPS... |
CCA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1721530 | 90 |
ATG... |
MKR... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1721541 | 54 |
TTG... |
LSR... |
TTG |
InCDS Overlapping sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3299545 | 3285 |
ATG... |
MNV... |
ATG |
CDS |
HFF,
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718162 | 174 |
CTG... |
LSF... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
481358 | 42 |
ATG... |
MLP... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280919 | 120 |
CTG... |
LWS... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280933 | 33 |
ATG... |
MSS... |
ATG |
InCDS Overlapping sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, BJ, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95471 | 63 |
CTG... |
LGL... |
CTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896361 | 96 |
TGG... |
WPG... |
TGG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
275445 | 48 |
CTG... |
LGQ... |
CTG |
Alternative NMD sORF Upstream |
LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280915 | 168 |
ATG... |
MWL... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, Blood, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97500 | 78 |
GTG... |
VAD... |
GTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
275485 | 48 |
ATG... |
MWT... |
ATG |
InCDS Overlapping sORF Downstream NMD |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, Blood, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901585 | 255 |
AGT... |
STR... |
AGT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97507 | 36 |
GTG... |
VMR... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896390 | 117 |
TCC... |
SYN... |
TCC |
Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896343 | 132 |
CAG... |
QSS... |
CAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
275463 | 57 |
ATG... |
MLM... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HeLa,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3069347 | 72 |
TTG... |
LTL... |
TTG |
Alternative sORF Upstream |
MM1S | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2298628 | 174 |
CTG... |
LCH... |
CTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718202 | 54 |
GTG... |
VCP... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718193 | 51 |
GTG... |
VPI... |
GTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Blood | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718178 | 39 |
CTG... |
LQS... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718197 | 30 |
CTG... |
LLC... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901587 | 162 |
CCA... |
PPS... |
CCA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280895 | 84 |
CTG... |
LHM... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718191 | 36 |
TTG... |
LYQ... |
TTG |
Downstream NMD sORF |
Blood, RPE-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
523609 | 33 |
ATG... |
MSR... |
ATG |
ncRNA sORF InCDS Overlapping |
BJ,
Blood,
HeLa,
MDA-MB-231, MM1S, U2OS, Brain_tumor, HEK293, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718180 | 39 |
TTG... |
LLG... |
TTG |
Downstream NMD sORF |
Blood, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896349 | 84 |
TAT... |
YGA... |
TAT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97481 | 90 |
GTG... |
VAT... |
GTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95505 | 132 |
GTG... |
VKQ... |
GTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896359 | 111 |
AGC... |
STG... |
AGC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896407 | 48 |
GAC... |
DFL... |
GAC |
Alternative Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100006 | 264 |
CTG... |
LAG... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HEK293, HeLa, hES, HFF, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718226 | 51 |
TTG... |
LRV... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
hES,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2680525 | 123 |
TTG... |
LTL... |
TTG |
Alternative sORF Upstream |
RPE-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95477 | 114 |
GTG... |
VDA... |
GTG |
Downstream NMD sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718220 | 42 |
CTG... |
LKS... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1203954 | 96 |
ATG... |
MWP... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95499 | 90 |
CTG... |
LDN... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
hES, HFF, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
630689 | 78 |
GTG... |
VCR... |
GTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
MDA-MB-231,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896339 | 156 |
AGC... |
SPS... |
AGC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1816496 | 42 |
CTG... |
LSE... |
CTG |
Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2298685 | 33 |
CTG... |
LCR... |
CTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2298683 | 63 |
GTG... |
VPC... |
GTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896377 | 102 |
CCC... |
PKV... |
CCC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1203958 | 78 |
TTG... |
LCP... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718222 | 30 |
CTG... |
LMT... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718184 | 39 |
TTG... |
LSP... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1367 | 183 |
CTG... |
LQC... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HEK293, HeLa, hES |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896392 | 36 |
CGT... |
RLL... |
CGT |
Alternative Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1816480 | 72 |
TTG... |
LTS... |
TTG |
Downstream NMD sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
275461 | 63 |
GTG... |
VWM... |
GTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HeLa,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97516 | 156 |
GTG... |
VLK... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97494 | 123 |
GTG... |
VKS... |
GTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901573 | 276 |
CAG... |
QSS... |
CAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97513 | 204 |
TTG... |
LIL... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3199816 | 189 |
GCT... |
ALL... |
GCT |
ncRNA sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95464 | 153 |
CTG... |
LVC... |
CTG |
CDS NMD sORF |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718213 | 63 |
GTG... |
VMS... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231, MM1S |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1721516 | 138 |
ATG... |
MAS... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
MDA-MB-231,
RPE-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718215 | 60 |
ATG... |
MSC... |
ATG |
ncRNA sORF InCDS Overlapping |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231,
MM1S, Brain_tumor, HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896396 | 105 |
CAG... |
QPQ... |
CAG |
Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280921 | 105 |
ATG... |
MTI... |
ATG |
sORF Alternative InCDS Overlapping |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa, HFF, Blood, LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95503 | 135 |
GTG... |
VVK... |
GTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95473 | 72 |
GTG... |
VPL... |
GTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HEK293, hES, HFF, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280913 | 171 |
CTG... |
LMW... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97486 | 45 |
CTG... |
LAR... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718195 | 45 |
GTG... |
VCG... |
GTG |
Downstream NMD sORF |
Blood | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718208 | 48 |
GTG... |
VHE... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
MDA-MB-231,
MM1S,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97518 | 153 |
TTG... |
LKS... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95513 | 72 |
CTG... |
LSG... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1721506 | 183 |
ATG... |
MEA... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896379 | 93 |
ATC... |
ILG... |
ATC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95475 | 135 |
CTG... |
LDH... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
guo_2014,
HEK293,
hES
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1499281 | 48 |
CTG... |
LQP... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896373 | 30 |
CCA... |
PSS... |
CCA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1203942 | 93 |
GTG... |
VAR... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2298698 | 129 |
ATG... |
MGI... |
ATG |
Downstream NMD sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97479 | 129 |
GTG... |
VLQ... |
GTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
HEK293, HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97498 | 87 |
GTG... |
VSD... |
GTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100004 | 270 |
GTG... |
VEL... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HEK293, HeLa, hES, HFF, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
406127 | 252 |
GAT... |
DGD... |
GAT |
ncRNA sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901575 | 264 |
GGT... |
GGQ... |
GGT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718171 | 30 |
CTG... |
LEY... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1721518 | 117 |
ATG... |
MSL... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2298652 | 66 |
ATG... |
MTG... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1816494 | 30 |
GTG... |
VDR... |
GTG |
Alternative Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
630701 | 69 |
GTG... |
VTE... |
GTG |
ncRNA sORF |
guo_2014,
HEK293,
hES,
THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95511 | 87 |
GTG... |
VED... |
GTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901593 | 72 |
AAT... |
NGP... |
AAT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901581 | 261 |
TGG... |
WPS... |
TGG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901603 | 204 |
AAT... |
NEE... |
AAT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
525756 | 78 |
CTG... |
LGA... |
CTG |
Alternative sORF Upstream |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896371 | 36 |
AAT... |
NGP... |
AAT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97492 | 141 |
GTG... |
VLH... |
GTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901597 | 66 |
CCA... |
PSS... |
CCA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896367 | 75 |
GTT... |
VWP... |
GTT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896333 | 249 |
TGT... |
CAT... |
TGT |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
523600 | 42 |
CTG... |
LVN... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
guo_2014,
HEK293,
HeLa,
hES, HFF, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2298650 | 72 |
TTG... |
LKM... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896347 | 114 |
CAA... |
QSG... |
CAA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896335 | 165 |
CAT... |
HLG... |
CAT |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896385 | 165 |
CCT... |
PAW... |
CCT |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3299539 | 777 |
ATG... |
MQI... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95509 | 90 |
CTG... |
LVE... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3299536 | 45 |
CTG... |
LDL... |
CTG |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
275483 | 63 |
GTG... |
VGE... |
GTG |
Downstream NMD sORF |
HeLa,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896345 | 120 |
GGT... |
GGQ... |
GGT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95515 | 51 |
GTG... |
VDF... |
GTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97472 | 177 |
GTG... |
VPP... |
GTG |
InCDS NMD Overlapping sORF |
Brain,
HAP1,
HEK293,
hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1203960 | 63 |
CTG... |
LVA... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
523594 | 63 |
GTG... |
VPL... |
GTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1046333 | 156 |
GTG... |
VEL... |
GTG |
ncRNA sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97476 | 156 |
TTG... |
LAP... |
TTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
HEK293,
HFF,
RPE-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896365 | 84 |
ATA... |
IWP... |
ATA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1046335 | 150 |
CTG... |
LAG... |
CTG |
ncRNA sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896357 | 150 |
CTT... |
LPR... |
CTT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1202240 | 42 |
GTG... |
VCP... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
523607 | 36 |
GTG... |
VMS... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HeLa,
MDA-MB-231,
MM1S, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280904 | 48 |
ATG... |
MGQ... |
ATG |
ncRNA sORF |
BJ,
HEK293,
HeLa,
LCL, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95461 | 147 |
GTG... |
VGN... |
GTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
HEK293, HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280911 | 177 |
TTG... |
LCL... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
934022 | 123 |
CTG... |
LAL... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
hES, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1203956 | 81 |
CTG... |
LLC... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1816488 | 42 |
GTG... |
VQG... |
GTG |
ncRNA sORF |
HeLa, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1721537 | 102 |
ATG... |
MGS... |
ATG |
InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100008 | 237 |
GTG... |
VTV... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
523604 | 48 |
GTG... |
VTC... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HeLa,
MDA-MB-231,
MM1S, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718169 | 36 |
TTG... |
LLL... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
97502 | 138 |
TTG... |
LDQ... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
guo_2014,
HEK293,
HFF
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280908 | 141 |
CTG... |
LGL... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
275443 | 75 |
CTG... |
LNA... |
CTG |
NMD sORF Upstream |
LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95493 | 165 |
CTG... |
LNC... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100010 | 231 |
GTG... |
VEF... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HEK293, HeLa, hES, HFF, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2298640 | 90 |
CTG... |
LGS... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280925 | 84 |
GTG... |
VTR... |
GTG |
InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, LCL, MDA-MB-231, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
630678 | 198 |
CTG... |
LLA... |
CTG |
InCDS NMD Overlapping sORF |
Blood,
MDA-MB-231,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
896331 | 186 |
GTT... |
VPP... |
GTT |
InCDS NMD Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1203962 | 60 |
GTG... |
VAL... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2298638 | 144 |
ATG... |
MAP... |
ATG |
CDS NMD sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
630674 | 117 |
ATG... |
MVG... |
ATG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231, THP-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280898 | 78 |
ATG... |
MAS... |
ATG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1816474 | 51 |
ATG... |
MTA... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HeLa, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1718218 | 48 |
CTG... |
LEL... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1203964 | 54 |
CTG... |
LST... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95501 | 78 |
CTG... |
LSK... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
guo_2014,
HEK293,
hES,
HFF, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95485 | 171 |
CTG... |
LLY... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HEK293, HeLa, hES, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901579 | 228 |
TAT... |
YGA... |
TAT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95487 | 123 |
CTG... |
LNS... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
280931 | 42 |
CTG... |
LRP... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
95495 | 138 |
CTG... |
LQP... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1202225 | 78 |
CTG... |
LTW... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
901589 | 135 |
CTT... |
LPR... |
CTT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Export data