Gene
Gene
ID CARD
ID
HGNC:11026
Aliases
4F2
4F2HC,
4T2HC,
CD98
CD98HC,
ENSG00000168003,
HGNC:11026
MDU1,
NACAE,
NCBI:6520
OFF:SLC3A2,
SLC3A2
Chromosome
11
Transcripts
144 ORFs
16 known transcripts
140 ORF to known transcript associations
MetamORF transcript ID The MetamORF ID of the transcript. This is an arbitrary ID that does not correspond to any official (Ensembl, NCBI...) transcript ID or external reference. |
Transcript ID
The official transcript ID (usually an Ensembl ID, e.g. ENST00000395565). |
Transcript name
The transcript name (e.g. MDK-202). |
Transcript biotype
The biotype of the transcript (as defined by Ensembl). |
ORFs
Display all the transcripts related to the entry. |
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908672 | ENST00000535296 | SLC3A2-206 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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105310 | ENST00000536981 | SLC3A2-208 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4618 | ENST00000539458 | SLC3A2-213 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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8573 | ENST00000537839 | SLC3A2-210 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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4654 | ENST00000539507 | SLC3A2-214 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8586 | ENST00000538682 | SLC3A2-212 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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406382 | UNKNOWN_TRANSCRIPT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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4659 | ENST00000542793 | SLC3A2-219 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4629 | ENST00000457660 | SLC3A2-205 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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4646 | ENST00000546312 | SLC3A2-223 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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9382 | ENST00000546253 | SLC3A2-222 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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294554 | ENST00000338663 | SLC3A2-201 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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286823 | ENST00000542922 | SLC3A2-220 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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2904424 | ENST00000377889 | SLC3A2-202 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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4651 | ENST00000535768 | SLC3A2-207 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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407834 | ENST00000377891 | SLC3A2-204 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8593 | ENST00000539891 | SLC3A2-215 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
ORFs
144 ORFs
16 known transcripts
140 ORF to known transcript associations
MetamORF ORF ID The MetamORF ID of the ORF. This is an unique ID referring to the ORF. |
ORF Length
The genomic length of the ORF (in bp). This length is defined as the sum of the lengths of each exon constituting the ORF (thus excluding its eventual introns) and includes both the start and the stop codons. |
Nucleic sequence The nucleic sequence of the ORF. |
Amino acid sequence The amino acid sequence of the ORF. |
Start codon
The start codon sequence of the ORF. |
ORF annotations
A comma-separated list of all the annotations computed by our algorithm for the ORF. This list includes the annotations computed for the ORF for all transcripts. See the section dedicated to ORF annotations in the advanced documentation for more details regarding the nomenclature we use. |
Cell types
A comma-separated list of all the cell types in which the ORF has already been identified. |
Transcripts
Display all the transcripts related to the entry. |
||||||||||||||||||||||||
908676 | 297 |
CCT... |
PPW... |
CCT |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
916460 | 57 |
CAT... |
HSW... |
CAT |
Alternative sORF Upstream |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908671 | 39 |
GTG... |
VCR... |
GTG |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
HeLa,
Jurkat,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
482458 | 57 |
TTG... |
LSH... |
TTG |
sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS, HFF |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
8572 | 279 |
CTG... |
LKG... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
105307 | 48 |
CTG... |
LAI... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
8585 | 201 |
TTG... |
LLQ... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3307726 | 203 |
ATG... |
MLF... |
ATG |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
409966 | 228 |
CAG... |
QKD... |
CAG |
ncRNA sORF |
HCT116,
HEK293,
HeLa,
Jurkat, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
529365 | 39 |
CTG... |
LIL... |
CTG |
sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, MDA-MB-231, Monocyte, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908701 | 123 |
ACG... |
TGM... |
ACG |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4667 | 60 |
CTG... |
LGL... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
8575 | 258 |
CTG... |
LSS... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MM1S |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4639 | 189 |
GTG... |
VLG... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4645 | 84 |
GTG... |
VSF... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
409636 | 207 |
CAG... |
QKD... |
CAG |
ncRNA sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
409976 | 186 |
CAG... |
QKD... |
CAG |
ncRNA sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
286818 | 150 |
ATG... |
MSL... |
ATG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3201326 | 147 |
CAA... |
QSA... |
CAA |
ncRNA sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4669 | 54 |
CTG... |
LDS... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4624 | 165 |
CTG... |
LAR... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
8581 | 231 |
GTG... |
VLG... |
GTG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
8577 | 249 |
CTG... |
LKV... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MM1S |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
102550 | 84 |
ATG... |
MGT... |
ATG |
Intronic sORF Alternative InCDS Overlapping |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS, Brain_tumor |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
102544 | 75 |
CTG... |
LLF... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
286827 | 57 |
ATG... |
MLW... |
ATG |
Alternative sORF Upstream Intronic |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, BJ, Blood, guo_2014, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
102547 | 36 |
ATG... |
MSP... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
916456 | 123 |
GCT... |
AAL... |
GCT |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3307717 | 741 |
CTT... |
LPR... |
CTT |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4661 | 42 |
GTG... |
VKT... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HEK293, HeLa, hES, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
1989170 | 60 |
TTG... |
LPT... |
TTG |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
105312 | 72 |
CTG... |
LDS... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
529339 | 45 |
CTG... |
LTA... |
CTG |
sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HeLa, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3183272 | 204 |
TTG... |
LSQ... |
TTG |
ncRNA sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
294556 | 162 |
GTG... |
VVA... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HEK293T,
HeLa, LCL, MDA-MB-231, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908682 | 66 |
GCT... |
AGH... |
GCT |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908710 | 72 |
GCA... |
AWG... |
GCA |
Intronic sORF |
HeLa,
Jurkat,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3307723 | 75 |
TTC... |
FST... |
TTC |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
286825 | 90 |
ATG... |
MSV... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
102526 | 138 |
TTG... |
LLQ... |
TTG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, loayza_puch_2016 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
534145 | 102 |
ATG... |
MRL... |
ATG |
sORF Alternative InCDS Overlapping |
Blood,
Brain_tumor,
HAP1, HEK293, HeLa, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
2904423 | 69 |
GTG... |
VRS... |
GTG |
sORF Upstream |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3307714 | 405 |
ATG... |
MSQ... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
1008416 | 141 |
CTG... |
LPP... |
CTG |
Intronic sORF |
guo_2014,
HEK293T,
HeLa,
MM1S |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4617 | 48 |
CTG... |
LGR... |
CTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
1008421 | 30 |
GTG... |
VAK... |
GTG |
Intronic sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
8568 | 114 |
CTG... |
LAR... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, MDA-MB-231, Monocyte, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4658 | 84 |
CTG... |
LWD... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
8564 | 150 |
CTG... |
LGT... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HEK293T, HeLa, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3223030 | 87 |
GTG... |
VHV... |
GTG |
sORF Upstream |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
407847 | 255 |
GGG... |
GPG... |
GGG |
Intronic sORF |
HCT116,
HeLa,
Jurkat,
THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
529354 | 138 |
CTG... |
LTC... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
guo_2014,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, MM1S, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
9365 | 279 |
CTG... |
LSS... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
8592 | 114 |
CTG... |
LDL... |
CTG |
sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, HeLa, HFF, loayza_puch_2016 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
105305 | 54 |
ATG... |
MPL... |
ATG |
sORF Alternative Upstream |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS, Brain_tumor, HFF |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
9367 | 252 |
GTG... |
VLG... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
917530 | 222 |
GAT... |
DDV... |
GAT |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
Jurkat,
THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4635 | 201 |
GTG... |
VKG... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HCT116, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, Jurkat, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
529367 | 33 |
CTG... |
LVL... |
CTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
482468 | 135 |
CTG... |
LQI... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, loayza_puch_2016 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
1298997 | 237 |
TTG... |
LCW... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293T | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4631 | 216 |
CTG... |
LSS... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
407833 | 84 |
CAT... |
HVA... |
CAT |
sORF Upstream |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908697 | 33 |
GGA... |
GLT... |
GGA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
286829 | 33 |
CTG... |
LAW... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
407851 | 177 |
GGC... |
GLS... |
GGC |
Intronic sORF |
Breast,
HCT116,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908684 | 174 |
GCT... |
AAL... |
GCT |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3200523 | 144 |
ACT... |
TPN... |
ACT |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
9386 | 228 |
CTG... |
LKV... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4650 | 69 |
TTG... |
LAE... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, Monocyte, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
407841 | 123 |
TCG... |
STP... |
TCG |
ncRNA sORF |
HCT116,
HeLa,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
102530 | 51 |
GTG... |
VRT... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908680 | 231 |
GGA... |
GAA... |
GGA |
sORF |
HeLa,
Jurkat,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4641 | 186 |
CTG... |
LGP... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4653 | 39 |
TTG... |
LRG... |
TTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908714 | 63 |
CCG... |
PLG... |
CCG |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
8570 | 105 |
CTG... |
LAR... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
1008414 | 156 |
CTG... |
LSF... |
CTG |
Intronic sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
2904426 | 60 |
CTG... |
LPH... |
CTG |
sORF Upstream |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
105309 | 81 |
CTG... |
LPF... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908693 | 141 |
CCC... |
PNY... |
CCC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908678 | 69 |
CTC... |
LTF... |
CTC |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4637 | 186 |
TTG... |
LCW... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
409971 | 180 |
GAT... |
DDV... |
GAT |
ncRNA sORF |
HCT116, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
294558 | 159 |
GTG... |
VAH... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HEK293T,
HeLa, LCL, MDA-MB-231, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
9369 | 150 |
TTG... |
LQS... |
TTG |
ncRNA sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, HeLa, HFF, loayza_puch_2016 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
1317313 | 39 |
CTG... |
LTV... |
CTG |
sORF Upstream |
HEK293, HeLa | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4620 | 201 |
CTG... |
LGT... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3307711 | 141 |
ATG... |
MSQ... |
ATG |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908699 | 33 |
GCC... |
AYS... |
GCC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908674 | 30 |
ATC... |
IRL... |
ATC |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
105794 | 207 |
CTG... |
LGP... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, Monocyte |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
9384 | 258 |
CTG... |
LKG... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MM1S, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3200526 | 129 |
TCA... |
SAT... |
TCA |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908712 | 75 |
TCC... |
STR... |
TCC |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4628 | 237 |
CTG... |
LKG... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3183274 | 174 |
TTG... |
LPA... |
TTG |
ncRNA sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
407843 | 36 |
ATT... |
ILV... |
ATT |
sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
8588 | 198 |
CTG... |
LQI... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3307720 | 437 |
ATG... |
MSQ... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
407837 | 165 |
CAG... |
QKD... |
CAG |
ncRNA sORF |
HCT116,
HEK293,
HeLa,
Jurkat, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908707 | 57 |
ATC... |
IPG... |
ATC |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
534139 | 66 |
ATG... |
MHP... |
ATG |
Alternative sORF Upstream |
BJ,
Blood,
Brain_tumor,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
917528 | 240 |
ATT... |
IHK... |
ATT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908705 | 78 |
GAT... |
DES... |
GAT |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
9377 | 249 |
CTG... |
LGP... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
9381 | 222 |
GTG... |
VKG... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HCT116, HEK293, HEK293T, HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
286822 | 93 |
CTG... |
LMS... |
CTG |
Intronic sORF |
guo_2014,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4626 | 156 |
CTG... |
LAR... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
9375 | 300 |
CTG... |
LKG... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
9373 | 264 |
GTG... |
VKG... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HCT116, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, Jurkat, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4622 | 186 |
CTG... |
LGT... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
9388 | 237 |
CTG... |
LSS... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908703 | 57 |
AGG... |
RLQ... |
AGG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4663 | 33 |
CTG... |
LAP... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HEK293, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3183276 | 186 |
CTG... |
LTS... |
CTG |
ncRNA sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4648 | 153 |
CTG... |
LDL... |
CTG |
Intronic sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HEK293T, HeLa, HFF, loayza_puch_2016, MM1S |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
2616400 | 36 |
TGG... |
WLP... |
TGG |
Intronic sORF |
HEK293,
HeLa,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
8566 | 135 |
CTG... |
LGT... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
8583 | 228 |
CTG... |
LGP... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
534143 | 120 |
CTG... |
LFS... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4633 | 207 |
CTG... |
LKV... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
105799 | 210 |
GTG... |
VLG... |
GTG |
ncRNA sORF |
Brain,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, HFF, Monocyte |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
9379 | 270 |
CTG... |
LKV... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908686 | 84 |
TCT... |
SEG... |
TCT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908689 | 177 |
ATT... |
IHK... |
ATT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908695 | 45 |
ACT... |
TRG... |
ACT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
296118 | 54 |
CTG... |
LSS... |
CTG |
ncRNA sORF |
HAP1,
HEK293T,
HeLa,
LCL |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
102539 | 30 |
CTG... |
LAI... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
916458 | 168 |
GCA... |
AEV... |
GCA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
294553 | 186 |
TTG... |
LSR... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
286816 | 153 |
ATG... |
MMS... |
ATG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
407839 | 159 |
GAT... |
DDV... |
GAT |
ncRNA sORF |
HCT116,
HEK293,
HeLa,
Jurkat, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
3307729 | 1986 |
ATG... |
MEL... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
1317315 | 72 |
CTG... |
LSC... |
CTG |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
HEK293, HeLa | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
4665 | 117 |
GTG... |
VTS... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, Jurkat, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
908719 | 75 |
TGG... |
WGC... |
TGG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
1010046 | 48 |
CTG... |
LSG... |
CTG |
Alternative sORF Upstream |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HEK293T, HeLa, hES, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
1208664 | 96 |
TTG... |
LAW... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
8579 | 243 |
GTG... |
VKG... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HCT116, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016 |
|||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
409638 | 201 |
GAT... |
DDV... |
GAT |
ncRNA sORF |
HCT116, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
1047858 | 111 |
TTG... |
LAP... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293, HeLa | |||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||
102537 | 36 |
ATG... |
MPL... |
ATG |
sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
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1208666 | 87 |
ATG... |
MQL... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, MDA-MB-231, RPE-1 |
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Export data