Gene
Gene
ID CARD
ID
HGNC:10769
Aliases
Cus1
ENSG00000087365,
HGNC:10769,
NCBI:10992
OFF:SF3B2,
SAP145,
SF3b1
SF3b145,
SF3B2
Chromosome
11
Transcripts
234 ORFs
11 known transcripts
238 ORF to known transcript associations
|
MetamORF transcript ID The MetamORF ID of the transcript. This is an arbitrary ID that does not correspond to any official (Ensembl, NCBI...) transcript ID or external reference. |
Transcript ID
The official transcript ID (usually an Ensembl ID, e.g. ENST00000395565). |
Transcript name
The transcript name (e.g. MDK-202). |
Transcript biotype
The biotype of the transcript (as defined by Ensembl). |
ORFs
Display all the transcripts related to the entry. |
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| 5440 | ENST00000530981 | SF3B2-210 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5394 | ENST00000525207 | SF3B2-204 | retained_intron | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 287868 | ENST00000530322 | SF3B2-209 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5447 | ENST00000534765 | SF3B2-216 | retained_intron | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5380 | ENST00000533421 | SF3B2-213 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5413 | ENST00000529994 | SF3B2-208 | retained_intron | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 294937 | ENST00000322535 | SF3B2-201 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5377 | ENST00000524475 | SF3B2-202 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 5391 | ENST00000526653 | SF3B2-205 | retained_intron | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 294934 | ENST00000524627 | SF3B2-203 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 4347713 | ENST00000610523 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 3308501 | UNKNOWN_TRANSCRIPT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ORFs
234 ORFs
11 known transcripts
238 ORF to known transcript associations
|
MetamORF ORF ID The MetamORF ID of the ORF. This is an unique ID referring to the ORF. |
ORF Length
The genomic length of the ORF (in bp). This length is defined as the sum of the lengths of each exon constituting the ORF (thus excluding its eventual introns) and includes both the start and the stop codons. |
Nucleic sequence The nucleic sequence of the ORF. |
Amino acid sequence The amino acid sequence of the ORF. |
Start codon
The start codon sequence of the ORF. |
ORF annotations
A comma-separated list of all the annotations computed by our algorithm for the ORF. This list includes the annotations computed for the ORF for all transcripts. See the section dedicated to ORF annotations in the advanced documentation for more details regarding the nomenclature we use. |
Cell types
A comma-separated list of all the cell types in which the ORF has already been identified. |
Transcripts
Display all the transcripts related to the entry. |
||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5439 | 84 |
ATG... |
MAD... |
ATG |
sORF |
Blood,
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231, THP-1, U2OS, Brain_tumor, HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287876 | 48 |
CTG... |
LWA... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 916655 | 114 |
GAA... |
EDP... |
GAA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5459 | 39 |
GTG... |
VTW... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HCT116, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, Jurkat, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5446 | 66 |
GTG... |
VRH... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 910007 | 45 |
CAT... |
HVH... |
CAT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5379 | 120 |
GTG... |
VLN... |
GTG |
ncRNA sORF |
guo_2014, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1596843 | 60 |
GTG... |
VER... |
GTG |
ncRNA sORF |
hES, loayza_puch_2016 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2054260 | 126 |
ATG... |
MLV... |
ATG |
sORF |
HEK293, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2054264 | 120 |
GTG... |
VAG... |
GTG |
sORF |
HEK293, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5431 | 138 |
CTG... |
LCH... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408270 | 102 |
GTT... |
VGG... |
GTT |
Intronic sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287905 | 57 |
CTG... |
LEA... |
CTG |
sORF |
HeLa,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909950 | 96 |
GTT... |
VLP... |
GTT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 105366 | 219 |
CTG... |
LQP... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HEK293, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408264 | 42 |
CGA... |
RDT... |
CGA |
sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200655 | 66 |
GGC... |
GFG... |
GGC |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483896 | 63 |
ATG... |
MTS... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
HEK293T,
hES,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287860 | 57 |
CTG... |
LQV... |
CTG |
sORF |
BJ,
Brain,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2317638 | 93 |
TTG... |
LAF... |
TTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2317636 | 99 |
TTG... |
LAL... |
TTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287884 | 39 |
CTG... |
LRR... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1049705 | 81 |
CTG... |
LKN... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3201244 | 288 |
GCA... |
ANL... |
GCA |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5376 | 63 |
CTG... |
LVE... |
CTG |
sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
hES, loayza_puch_2016 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1131141 | 96 |
CTG... |
LKE... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408256 | 75 |
GGG... |
GTG... |
GGG |
Intronic sORF |
HCT116, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200663 | 255 |
AAG... |
KKK... |
AAG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287862 | 42 |
ATG... |
MGT... |
ATG |
ncRNA sORF |
BJ,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 530117 | 165 |
TTG... |
LGP... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294933 | 147 |
ATG... |
MSS... |
ATG |
sORF |
HEK293T,
HeLa,
LCL,
loayza_puch_2016, RPE-1, Brain_tumor, HEK293, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909938 | 36 |
AGG... |
RNM... |
AGG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287874 | 57 |
ATG... |
MTP... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5412 | 231 |
GTG... |
VRG... |
GTG |
Intronic sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HEK293, HeLa, hES, HFF, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408250 | 225 |
GGG... |
GVS... |
GGG |
Intronic sORF |
HCT116,
HEK293,
HeLa,
Jurkat, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294971 | 225 |
CTG... |
LNF... |
CTG |
sORF |
BJ,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 409717 | 60 |
ATC... |
IAR... |
ATC |
sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1596875 | 42 |
TTG... |
LRR... |
TTG |
sORF |
BJ, loayza_puch_2016 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1008667 | 75 |
CTG... |
LMQ... |
CTG |
ncRNA sORF |
guo_2014,
HEK293,
HeLa
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287900 | 66 |
CTG... |
LPF... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287856 | 75 |
TTG... |
LIV... |
TTG |
sORF |
HEK293,
hES,
LCL
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483906 | 102 |
ATG... |
MRQ... |
ATG |
sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293T,
HeLa, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 534329 | 84 |
CTG... |
LKL... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287858 | 69 |
GTG... |
VYF... |
GTG |
sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909929 | 174 |
TGG... |
WHR... |
TGG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483902 | 120 |
GTG... |
VMK... |
GTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293T,
hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909956 | 57 |
GAA... |
EDP... |
GAA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5457 | 36 |
ATG... |
MRS... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS, Brain_tumor |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287881 | 93 |
GTG... |
VKT... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5396 | 114 |
GTG... |
VGP... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5433 | 216 |
GTG... |
VPR... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 916657 | 96 |
GGA... |
GEP... |
GGA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294941 | 144 |
TTG... |
LTN... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293,
HEK293T,
HeLa,
hES, LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5444 | 30 |
ATG... |
MDH... |
ATG |
sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, HAP1, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 938302 | 129 |
GTG... |
VAL... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200686 | 54 |
GAA... |
EEN... |
GAA |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5425 | 252 |
TTG... |
LVH... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294951 | 45 |
ATG... |
MGT... |
ATG |
sORF |
HEK293T,
HFF,
LCL,
loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS, Brain_tumor, HEK293, HeLa |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909979 | 237 |
GCC... |
ATR... |
GCC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3201253 | 150 |
AAT... |
NPQ... |
AAT |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3201247 | 243 |
TGT... |
CLE... |
TGT |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5419 | 78 |
CTG... |
LGT... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294957 | 297 |
GTG... |
VAG... |
GTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287872 | 78 |
CTG... |
LGV... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 102953 | 129 |
GTG... |
VLP... |
GTG |
Intronic sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5449 | 45 |
CTG... |
LCC... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287867 | 111 |
CTG... |
LLQ... |
CTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287864 | 36 |
GTG... |
VSQ... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
HEK293,
hES,
LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2317660 | 30 |
ATG... |
MPT... |
ATG |
sORF |
MDA-MB-231,
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200689 | 69 |
TAT... |
YDM... |
TAT |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408262 | 51 |
GAA... |
EGV... |
GAA |
sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3201235 | 123 |
GGC... |
GFG... |
GGC |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 916649 | 90 |
GAG... |
ERL... |
GAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 910003 | 54 |
AGC... |
SSS... |
AGC |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1512726 | 84 |
TTG... |
LRR... |
TTG |
sORF |
BJ,
HEK293,
HeLa,
HFF, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909959 | 39 |
GGA... |
GEP... |
GGA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408254 | 219 |
TCC... |
SSE... |
TCC |
Intronic sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1008689 | 144 |
CTG... |
LPD... |
CTG |
Intronic sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1440623 | 279 |
GTG... |
VKK... |
GTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3201237 | 225 |
CAG... |
QML... |
CAG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3308503 | 242 |
ATG... |
MSA... |
ATG |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408268 | 120 |
GAG... |
EKR... |
GAG |
Intronic sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200665 | 111 |
CCC... |
PSG... |
CCC |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909932 | 192 |
GGC... |
GFP... |
GGC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200697 | 36 |
GAA... |
EGR... |
GAA |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909946 | 75 |
GGG... |
GHP... |
GGG |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408245 | 42 |
GGA... |
GDE... |
GGA |
Intronic sORF |
HCT116, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408274 | 297 |
CAG... |
QKY... |
CAG |
Intronic sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408241 | 135 |
GAG... |
EPV... |
GAG |
ncRNA sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5393 | 123 |
GTG... |
VGP... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, hES, HFF, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483871 | 120 |
GTG... |
VGE... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408237 | 48 |
ATC... |
IAR... |
ATC |
sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408239 | 114 |
AAT... |
NRP... |
AAT |
ncRNA sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5386 | 255 |
TTG... |
LGL... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 102955 | 126 |
TTG... |
LPE... |
TTG |
Intronic sORF |
Brain,
guo_2014,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 102937 | 60 |
CTG... |
LKE... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HCT116, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, Jurkat, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909982 | 210 |
CGC... |
RHW... |
CGC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909940 | 84 |
GAG... |
ELL... |
GAG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200669 | 207 |
TCT... |
SGD... |
TCT |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909969 | 192 |
CAG... |
QRR... |
CAG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287890 | 45 |
GTG... |
VAL... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HCT116, HEK293, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1008677 | 111 |
GTG... |
VQG... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293T
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5390 | 30 |
ATG... |
MSS... |
ATG |
sORF Intronic |
HEK293T,
loayza_puch_2016,
Blood,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483884 | 72 |
CTG... |
LKF... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Flp-In_T-REx-293,
HEK293,
HEK293T,
MDA-MB-231, MM1S, Monocyte, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909985 | 87 |
CCC... |
PMA... |
CCC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909961 | 78 |
CAG... |
QML... |
CAG |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 409725 | 84 |
ACA... |
TVM... |
ACA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483869 | 144 |
TTG... |
LGP... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 938306 | 105 |
CTG... |
LKL... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MM1S |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287892 | 39 |
CTG... |
LIP... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HCT116, HEK293, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909994 | 54 |
CCT... |
PYH... |
CCT |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3201251 | 174 |
GGG... |
GNW... |
GGG |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1297699 | 69 |
ATG... |
MCF... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
HEK293T,
HeLa
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3308515 | 2688 |
ATG... |
MAT... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3223695 | 51 |
GTG... |
VFS... |
GTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1094868 | 159 |
CTG... |
LCL... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
HFF,
MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909977 | 162 |
TCA... |
SRP... |
TCA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5437 | 84 |
TTG... |
LRS... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909996 | 48 |
CAC... |
HSW... |
CAC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909987 | 78 |
GAT... |
DCH... |
GAT |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909999 | 30 |
ATC... |
ISA... |
ATC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294959 | 273 |
ATG... |
MRL... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287909 | 33 |
CTG... |
LEW... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909971 | 183 |
ACC... |
TLS... |
ACC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5427 | 144 |
CTG... |
LCL... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294939 | 186 |
CTG... |
LRR... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294943 | 126 |
CTG... |
LQP... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Flp-In_T-REx-293,
HEK293,
HEK293T, hES, LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1317800 | 132 |
GTG... |
VTE... |
GTG |
Intronic sORF |
HEK293, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3201239 | 213 |
CGT... |
RPW... |
CGT |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5406 | 78 |
TTG... |
LEK... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 530156 | 96 |
TTG... |
LGL... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, HFF, MM1S, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294961 | 267 |
CTG... |
LGN... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 530158 | 90 |
CTG... |
LIP... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, HFF, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 530121 | 141 |
GTG... |
VGE... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483890 | 78 |
ATG... |
MMT... |
ATG |
sORF Alternative InCDS Overlapping |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, BJ, HEK293T, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287898 | 69 |
TTG... |
LLP... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, LCL, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 916653 | 126 |
CCA... |
PGF... |
CCA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408278 | 54 |
AGA... |
RRR... |
AGA |
Intronic sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5410 | 75 |
ATG... |
MLA... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408248 | 51 |
CAG... |
QRQ... |
CAG |
Intronic sORF |
HCT116, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 534323 | 234 |
TTG... |
LGL... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483875 | 102 |
CTG... |
LSE... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909975 | 168 |
TTC... |
FTS... |
TTC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294963 | 252 |
ATG... |
MGT... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483877 | 78 |
TTG... |
LAQ... |
TTG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5400 | 57 |
CTG... |
LFP... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408276 | 48 |
GCA... |
ACA... |
GCA |
Intronic sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294945 | 102 |
TTG... |
LKR... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Flp-In_T-REx-293,
HEK293,
HEK293T, hES, LCL, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294931 | 69 |
CTG... |
LQV... |
CTG |
sORF |
HEK293,
HEK293T,
HeLa,
hES, LCL, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 409723 | 153 |
CAG... |
QRN... |
CAG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 482704 | 63 |
TTG... |
LTS... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909936 | 111 |
GAG... |
ERL... |
GAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5442 | 45 |
TTG... |
LPC... |
TTG |
sORF |
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200684 | 66 |
TGT... |
CVA... |
TGT |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5451 | 66 |
CTG... |
LSC... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1008665 | 78 |
TTG... |
LLM... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
HeLa |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294967 | 231 |
ATG... |
MLL... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 938308 | 99 |
TTG... |
LAQ... |
TTG |
ncRNA sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294947 | 81 |
GTG... |
VMM... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
HEK293T,
hES,
LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909990 | 33 |
TGC... |
CWW... |
TGC |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3201241 | 198 |
CAG... |
QRQ... |
CAG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200675 | 54 |
TCA... |
SSN... |
TCA |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294936 | 222 |
ATG... |
MLA... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS, Brain_tumor, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294953 | 30 |
ATG... |
MRG... |
ATG |
sORF |
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231,
MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 635828 | 51 |
CTG... |
LFL... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HeLa, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 938304 | 123 |
CTG... |
LSE... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5408 | 66 |
CTG... |
LQL... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909963 | 33 |
AAA... |
KAP... |
AAA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408272 | 93 |
GCC... |
AMM... |
GCC |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5435 | 183 |
CTG... |
LQG... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 482683 | 153 |
CTG... |
LCY... |
CTG |
sORF |
HEK293T, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3308512 | 1163 |
CCC... |
PEP... |
CCC |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1512721 | 159 |
CTG... |
LMK... |
CTG |
sORF |
BJ,
hES,
MDA-MB-231,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294965 | 240 |
TTG... |
LEP... |
TTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287907 | 36 |
CTG... |
LLE... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483879 | 57 |
TTG... |
LLM... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3308506 | 821 |
ATG... |
MAT... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1297706 | 135 |
TTG... |
LGT... |
TTG |
sORF |
HEK293,
HEK293T,
HeLa,
MM1S |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294973 | 81 |
CTG... |
LQT... |
CTG |
sORF |
HAP1,
HEK293T,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909942 | 117 |
TGT... |
CVT... |
TGT |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5402 | 42 |
GTG... |
VVP... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3308500 | 108 |
AGG... |
RSF... |
AGG |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5421 | 291 |
GTG... |
VEM... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483873 | 108 |
GTG... |
VAL... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1319954 | 81 |
GTG... |
VYF... |
GTG |
sORF |
HEK293,
HeLa,
hES
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 102929 | 51 |
CTG... |
LQS... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287903 | 72 |
GTG... |
VAL... |
GTG |
sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293T,
HeLa, LCL, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909973 | 255 |
CTC... |
LLV... |
CTC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5455 | 33 |
CTG... |
LKS... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 482693 | 66 |
TTG... |
LFC... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ, HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287886 | 195 |
GTG... |
VLG... |
GTG |
Intronic sORF |
HeLa, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5382 | 117 |
CTG... |
LNR... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909944 | 102 |
GGA... |
GTT... |
GGA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 916659 | 78 |
CTT... |
LYY... |
CTT |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 482710 | 36 |
ATG... |
MPS... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5423 | 276 |
GTG... |
VTA... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5404 | 102 |
GTG... |
VGP... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5384 | 102 |
TTG... |
LRG... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1094870 | 153 |
CTG... |
LCH... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294949 | 99 |
TTG... |
LRS... |
TTG |
InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
hES,
LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483894 | 66 |
GTG... |
VMT... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
HEK293T,
hES,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5388 | 240 |
CTG... |
LQP... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 910001 | 147 |
ACA... |
TPQ... |
ACA |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483881 | 54 |
CTG... |
LMQ... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5415 | 222 |
GTG... |
VSS... |
GTG |
Intronic sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HEK293, HeLa, hES, HFF, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3308509 | 1061 |
ATG... |
MAT... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 482706 | 39 |
ATG... |
MMP... |
ATG |
sORF Alternative InCDS Overlapping |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, Blood, HAP1, HEK293T, hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483900 | 156 |
ATG... |
MKN... |
ATG |
sORF |
BJ,
HEK293T,
hES,
MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5398 | 93 |
TTG... |
LPM... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, loayza_puch_2016, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5417 | 87 |
CTG... |
LRA... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200673 | 33 |
CTC... |
LCA... |
CTC |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1732415 | 60 |
CTG... |
LGC... |
CTG |
sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483886 | 30 |
TTG... |
LRL... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293T, HeLa, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 910012 | 276 |
CGG... |
REQ... |
CGG |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294969 | 228 |
CTG... |
LLN... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5453 | 54 |
GTG... |
VWK... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1726942 | 60 |
CTG... |
LGC... |
CTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5429 | 222 |
GTG... |
VPV... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2054262 | 123 |
CTG... |
LVA... |
CTG |
sORF |
HEK293, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 409727 | 48 |
TCC... |
SMG... |
TCC |
sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 530153 | 48 |
GTG... |
VAD... |
GTG |
InCDS Overlapping sORF |
Flp-In_T-REx-293,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909948 | 48 |
AGA... |
RHG... |
AGA |
sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200691 | 78 |
AGG... |
RAR... |
AGG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909954 | 69 |
CCA... |
PGF... |
CCA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 409719 | 114 |
GAG... |
EPV... |
GAG |
ncRNA sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909952 | 51 |
CCT... |
PLW... |
CCT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 530119 | 42 |
GTG... |
VWV... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
HEK293,
MDA-MB-231,
RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 294955 | 300 |
CTG... |
LVA... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200659 | 66 |
CGT... |
RPW... |
CGT |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 916646 | 171 |
GGC... |
GFP... |
GGC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287911 | 81 |
TTG... |
LSF... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483892 | 75 |
ATG... |
MTA... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
HEK293T,
hES,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200682 | 135 |
TTC... |
FTV... |
TTC |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483904 | 117 |
ATG... |
MKT... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293T,
hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Export data