Gene
Gene
ID CARD
ID
HGNC:11327
Aliases
ENSG00000149136
FACT80,
HGNC:11327,
NCBI:6749
OFF:SSRP1,
SSRP1
Chromosome
11
Transcripts
203 ORFs
5 known transcripts
209 ORF to known transcript associations
MetamORF transcript ID The MetamORF ID of the transcript. This is an arbitrary ID that does not correspond to any official (Ensembl, NCBI...) transcript ID or external reference. |
Transcript ID
The official transcript ID (usually an Ensembl ID, e.g. ENST00000395565). |
Transcript name
The transcript name (e.g. MDK-202). |
Transcript biotype
The biotype of the transcript (as defined by Ensembl). |
ORFs
Display all the transcripts related to the entry. |
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3480 | ENST00000293880 | SSRP1-202 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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8158 | ENST00000278412 | SSRP1-201 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3522 | ENST00000526696 | SSRP1-203 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3483 | ENST00000635721 | SSRP1-205 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3533 | ENST00000529002 | SSRP1-204 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3314171 | UNKNOWN_TRANSCRIPT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
ORFs
203 ORFs
5 known transcripts
209 ORF to known transcript associations
MetamORF ORF ID The MetamORF ID of the ORF. This is an unique ID referring to the ORF. |
ORF Length
The genomic length of the ORF (in bp). This length is defined as the sum of the lengths of each exon constituting the ORF (thus excluding its eventual introns) and includes both the start and the stop codons. |
Nucleic sequence The nucleic sequence of the ORF. |
Amino acid sequence The amino acid sequence of the ORF. |
Start codon
The start codon sequence of the ORF. |
ORF annotations
A comma-separated list of all the annotations computed by our algorithm for the ORF. This list includes the annotations computed for the ORF for all transcripts. See the section dedicated to ORF annotations in the advanced documentation for more details regarding the nomenclature we use. |
Cell types
A comma-separated list of all the cell types in which the ORF has already been identified. |
Transcripts
Display all the transcripts related to the entry. |
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1820925 | 30 |
CTG... |
LLL... |
CTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293846 | 75 |
ATG... |
MRA... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Brain_tumor,
HAP1,
HEK293, HeLa, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3530 | 33 |
TTG... |
LPR... |
TTG |
sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3505 | 183 |
CTG... |
LLD... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293,
HEK293T,
hES
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820943 | 114 |
ATG... |
MQS... |
ATG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200304 | 123 |
TGC... |
CCG... |
TGC |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8182 | 177 |
ATG... |
MRS... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
Brain_tumor,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285129 | 126 |
CTG... |
LPA... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293850 | 87 |
TTG... |
LCL... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
409533 | 135 |
CAG... |
QTI... |
CAG |
InCDS Overlapping sORF |
HCT116, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483583 | 117 |
CTG... |
LPA... |
CTG |
sORF |
HEK293,
HEK293T,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2548373 | 213 |
ATG... |
MTA... |
ATG |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
482123 | 48 |
TTG... |
LRN... |
TTG |
sORF |
HEK293T,
HeLa,
hES,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820909 | 30 |
TTG... |
LYF... |
TTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407431 | 183 |
AGC... |
SKE... |
AGC |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820937 | 96 |
GTG... |
VPS... |
GTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907060 | 222 |
TCC... |
SKS... |
TCC |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820915 | 87 |
TTG... |
LLE... |
TTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407435 | 51 |
GGA... |
GGR... |
GGA |
sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407433 | 195 |
GAG... |
ESF... |
GAG |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293871 | 186 |
GTG... |
VGS... |
GTG |
sORF |
HEK293,
HEK293T,
LCL
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293869 | 153 |
CTG... |
LAC... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285127 | 108 |
ATG... |
MRV... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201134 | 117 |
AAA... |
KLR... |
AAA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
634609 | 69 |
GTG... |
VTS... |
GTG |
sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3519 | 102 |
CTG... |
LDP... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS, Jurkat |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820919 | 51 |
TTG... |
LSC... |
TTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820947 | 138 |
TTG... |
LVP... |
TTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3489 | 132 |
CTG... |
LHT... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8186 | 81 |
TTG... |
LTT... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820935 | 75 |
CTG... |
LLV... |
CTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201127 | 171 |
TGC... |
CCG... |
TGC |
InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3539 | 42 |
ATG... |
MAM... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101953 | 156 |
CTG... |
LGH... |
CTG |
sORF |
guo_2014,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
634607 | 54 |
TTG... |
LRY... |
TTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200288 | 123 |
GCT... |
ASR... |
GCT |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3479 | 75 |
TTG... |
LPI... |
TTG |
Intronic sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
LCL, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
634603 | 36 |
ATG... |
MPS... |
ATG |
sORF Alternative InCDS Overlapping |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231,
RPE-1, THP-1, Brain_tumor, HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8192 | 138 |
GTG... |
VVV... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200298 | 84 |
TCC... |
SWH... |
TCC |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3499 | 177 |
CTG... |
LLY... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200286 | 111 |
AAG... |
KSL... |
AAG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1724946 | 30 |
ATG... |
MPG... |
ATG |
sORF |
Blood,
HeLa,
MDA-MB-231,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8174 | 126 |
TTG... |
LTL... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3507 | 186 |
CTG... |
LLL... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293, HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3528 | 141 |
GTG... |
VVV... |
GTG |
sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483600 | 114 |
ATG... |
MDL... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, Blood, HEK293T, hES, MDA-MB-231, |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200291 | 42 |
GCA... |
AAK... |
GCA |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3493 | 129 |
GTG... |
VHI... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3482 | 78 |
CTG... |
LAS... |
CTG |
sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820945 | 66 |
ATG... |
MKC... |
ATG |
Intronic sORF Alternative Downstream |
HeLa,
Brain_tumor,
HEK293,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3509 | 192 |
GTG... |
VSL... |
GTG |
Intronic sORF |
HEK293, HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2548375 | 219 |
ATG... |
MPM... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285110 | 93 |
ATG... |
MRA... |
ATG |
Intronic sORF |
BJ,
Flp-In_T-REx-293,
HEK293,
HeLa, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3487 | 123 |
GTG... |
VAQ... |
GTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1724960 | 42 |
TTG... |
LST... |
TTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1008025 | 138 |
CTG... |
LLT... |
CTG |
sORF |
guo_2014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200308 | 69 |
CAG... |
QVK... |
CAG |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
638168 | 114 |
ATG... |
MTQ... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, BJ, Blood, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293848 | 78 |
GTG... |
VMR... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907079 | 282 |
AGG... |
RQA... |
AGG |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200296 | 69 |
GCA... |
ASR... |
GCA |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3541 | 66 |
ATG... |
MDL... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293875 | 75 |
TTG... |
LRG... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293,
HEK293T,
HeLa,
LCL, MDA-MB-231, MM1S |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
482119 | 36 |
ATG... |
MCP... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, BJ, Blood, HAP1, HEK293T, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314170 | 2130 |
ATG... |
MAE... |
ATG |
CDS |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907083 | 300 |
GCA... |
ALP... |
GCA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8190 | 129 |
ATG... |
MTF... |
ATG |
sORF Alternative InCDS Overlapping |
Blood,
Brain_tumor,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3517 | 60 |
CTG... |
LIL... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8160 | 159 |
ATG... |
MPA... |
ATG |
InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8184 | 195 |
CTG... |
LCT... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8164 | 201 |
ATG... |
MPP... |
ATG |
InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Brain_tumor,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407443 | 33 |
GAT... |
DPS... |
GAT |
Intronic sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820939 | 45 |
CTG... |
LCH... |
CTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407452 | 129 |
GAA... |
EVE... |
GAA |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2314247 | 48 |
ATG... |
MLT... |
ATG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3535 | 45 |
TTG... |
LCE... |
TTG |
sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407427 | 48 |
AGT... |
STP... |
AGT |
Intronic sORF |
HCT116, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3549 | 255 |
TTG... |
LSR... |
TTG |
sORF |
BJ,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907074 | 243 |
TCA... |
SST... |
TCA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
482101 | 48 |
ATG... |
MPM... |
ATG |
sORF |
HEK293T,
HeLa,
MM1S
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1505733 | 36 |
ATG... |
MRT... |
ATG |
sORF |
BJ, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3513 | 63 |
TTG... |
LRV... |
TTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314179 | 153 |
CTG... |
LLS... |
CTG |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820949 | 174 |
TTG... |
LPS... |
TTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820941 | 105 |
CTG... |
LDS... |
CTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3551 | 261 |
CTG... |
LRL... |
CTG |
sORF |
BJ,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, Jurkat, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3503 | 102 |
GTG... |
VHY... |
GTG |
Intronic sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907111 | 60 |
TTA... |
LNC... |
TTA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293867 | 141 |
CTG... |
LAG... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
634611 | 72 |
TTG... |
LVT... |
TTG |
sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293863 | 93 |
GTG... |
VTV... |
GTG |
sORF |
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483602 | 126 |
TTG... |
LLW... |
TTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200306 | 123 |
CCA... |
PAP... |
CCA |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201120 | 33 |
AGA... |
RGT... |
AGA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483585 | 132 |
TTG... |
LTA... |
TTG |
sORF |
HEK293,
HEK293T,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314173 | 578 |
ATG... |
MEK... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907072 | 36 |
CTT... |
LCS... |
CTT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201138 | 255 |
AGG... |
RQA... |
AGG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820953 | 207 |
ATG... |
MSR... |
ATG |
Intronic sORF Alternative Downstream Overlapping |
HeLa,
Brain_tumor,
HEK293, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3532 | 33 |
CTG... |
LEL... |
CTG |
sORF |
BJ,
guo_2014,
HEK293,
LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820917 | 96 |
CTG... |
LFK... |
CTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293861 | 87 |
GTG... |
VTG... |
GTG |
sORF |
HEK293,
HEK293T,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407437 | 171 |
TAC... |
YPL... |
TAC |
Intronic sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907070 | 30 |
TCG... |
SWY... |
TCG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285117 | 39 |
CTG... |
LEG... |
CTG |
sORF |
BJ,
LCL,
MM1S
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201122 | 105 |
TTT... |
FPR... |
TTT |
InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907102 | 39 |
CCG... |
PGA... |
CCG |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8180 | 165 |
TTG... |
LST... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3537 | 36 |
ATG... |
MST... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, Jurkat, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407441 | 75 |
TAT... |
YEM... |
TAT |
Intronic sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
916185 | 273 |
GCA... |
ALP... |
GCA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820931 | 69 |
GTG... |
VCM... |
GTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907066 | 30 |
GGG... |
GHS... |
GGG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285112 | 96 |
GTG... |
VMR... |
GTG |
Intronic sORF |
Flp-In_T-REx-293,
HEK293,
HeLa,
LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407454 | 90 |
TCT... |
SGA... |
TCT |
sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201132 | 108 |
CCA... |
PSR... |
CCA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293865 | 99 |
ATG... |
MRV... |
ATG |
sORF |
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3497 | 165 |
CTG... |
LER... |
CTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293857 | 78 |
ATG... |
MRR... |
ATG |
sORF |
HEK293,
HEK293T,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200300 | 87 |
CAG... |
QTI... |
CAG |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820921 | 105 |
CTG... |
LLV... |
CTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820913 | 84 |
CTG... |
LEQ... |
CTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285121 | 87 |
ATG... |
MRR... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8176 | 150 |
GTG... |
VVP... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3511 | 45 |
CTG... |
LVN... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
482099 | 42 |
ATG... |
MTA... |
ATG |
sORF |
HEK293T, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1136861 | 36 |
CTG... |
LIS... |
CTG |
sORF |
HEK293,
HEK293T,
HeLa,
hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285108 | 33 |
TTG... |
LVF... |
TTG |
Intronic sORF |
HAP1,
HEK293,
HeLa,
LCL, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
409535 | 171 |
CCT... |
PEE... |
CCT |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3547 | 210 |
GTG... |
VDN... |
GTG |
sORF |
Brain,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1049486 | 114 |
TTG... |
LRP... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293,
HEK293T,
MDA-MB-231,
MM1S |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2314243 | 39 |
CTG... |
LMR... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907062 | 30 |
CAT... |
HHP... |
CAT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3485 | 111 |
ATG... |
MPA... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407456 | 228 |
AAT... |
NSK... |
AAT |
sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200313 | 132 |
CCT... |
PVH... |
CCT |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101948 | 81 |
ATG... |
MTQ... |
ATG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1130672 | 177 |
TTG... |
LER... |
TTG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483598 | 90 |
ATG... |
MAM... |
ATG |
sORF |
HAP1,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285131 | 141 |
TTG... |
LTA... |
TTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907058 | 36 |
AAG... |
KRE... |
AAG |
Intronic sORF |
HEK293, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200311 | 171 |
CCA... |
PLL... |
CCA |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1047464 | 84 |
ATG... |
MSH... |
ATG |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820929 | 138 |
GTG... |
VYV... |
GTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285152 | 33 |
CTG... |
LAP... |
CTG |
sORF |
BJ,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407429 | 90 |
AGA... |
RAL... |
AGA |
Intronic sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1632554 | 54 |
ATG... |
MNM... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, Flp-In_T-REx-293, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3524 | 96 |
ATG... |
MAR... |
ATG |
sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907123 | 36 |
CCG... |
PGP... |
CCG |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2314245 | 45 |
CTG... |
LTL... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907081 | 198 |
TCC... |
SYK... |
TCC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907093 | 78 |
CAA... |
QTR... |
CAA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2548371 | 201 |
ATG... |
MTQ... |
ATG |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
482121 | 78 |
TTG... |
LTL... |
TTG |
sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200294 | 36 |
GGG... |
GAH... |
GGG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201136 | 144 |
CCA... |
PLL... |
CCA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820911 | 54 |
CTG... |
LGP... |
CTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3521 | 84 |
TTG... |
LTT... |
TTG |
sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3543 | 78 |
TTG... |
LLW... |
TTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, Jurkat, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907104 | 93 |
TGT... |
CVV... |
TGT |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
634601 | 48 |
CTG... |
LHL... |
CTG |
sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, MDA-MB-231, MM1S, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
916187 | 60 |
CCA... |
PQY... |
CCA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285114 | 105 |
TTG... |
LCL... |
TTG |
Intronic sORF |
Flp-In_T-REx-293,
HEK293,
HeLa,
LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1731591 | 60 |
ATG... |
MKG... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3515 | 126 |
GTG... |
VEK... |
GTG |
Intronic sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8162 | 180 |
CTG... |
LHT... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3201124 | 117 |
GCA... |
ASR... |
GCA |
InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483591 | 216 |
TTG... |
LDL... |
TTG |
sORF |
HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3491 | 153 |
ATG... |
MPP... |
ATG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820972 | 48 |
TTG... |
LIL... |
TTG |
sORF |
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3526 | 132 |
ATG... |
MTF... |
ATG |
sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483604 | 129 |
GTG... |
VLL... |
GTG |
sORF |
Blood,
HEK293T,
HeLa,
hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3314176 | 463 |
ATG... |
MEK... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820951 | 180 |
TTG... |
LRL... |
TTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820933 | 72 |
TTG... |
LVC... |
TTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8166 | 207 |
TTG... |
LGS... |
TTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
483596 | 84 |
ATG... |
MST... |
ATG |
sORF |
HAP1,
HEK293T,
HeLa,
hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907056 | 57 |
AGA... |
RRT... |
AGA |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907100 | 39 |
CTA... |
LPH... |
CTA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907077 | 75 |
CTC... |
LRT... |
CTC |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285125 | 102 |
GTG... |
VTV... |
GTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
916190 | 48 |
CCG... |
PGP... |
CCG |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
409531 | 72 |
AGA... |
RAL... |
AGA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1724948 | 36 |
CTG... |
LRM... |
CTG |
sORF |
Blood,
HeLa,
MDA-MB-231,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907068 | 72 |
ACT... |
TRS... |
ACT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8178 | 156 |
TTG... |
LLV... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200321 | 87 |
TGC... |
CFP... |
TGC |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3545 | 81 |
GTG... |
VLL... |
GTG |
sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
907096 | 63 |
CCA... |
PQY... |
CCA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8188 | 93 |
ATG... |
MAR... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407439 | 42 |
GTA... |
VNR... |
GTA |
Intronic sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
285123 | 96 |
GTG... |
VTG... |
GTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820927 | 63 |
ATG... |
MSL... |
ATG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3200302 | 114 |
TGC... |
CQP... |
TGC |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3495 | 222 |
CTG... |
LCT... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293873 | 210 |
TTG... |
LSS... |
TTG |
sORF |
HEK293,
HEK293T,
LCL
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1439908 | 252 |
GTG... |
VKK... |
GTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407450 | 99 |
ACC... |
TKN... |
ACC |
Intronic sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8172 | 120 |
TTG... |
LKL... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Flp-In_T-REx-293,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, hES, MDA-MB-231, MM1S |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3501 | 93 |
CTG... |
LFL... |
CTG |
Intronic sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820923 | 108 |
CTG... |
LLL... |
CTG |
Intronic sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8157 | 126 |
CTG... |
LAS... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, LCL, loayza_puch_2016, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Export data