Gene
Gene
ID CARD
ID
NCBI:74122
Aliases
1200015A22Rik
ENSMUSG00000030095,
LUMA,
MGI:1921372
NCBI:74122,
OFF:Tmem43,
Tmem43
Chromosome
6
Transcripts
59 ORFs
5 known transcripts
78 ORF to known transcript associations
|
MetamORF transcript ID The MetamORF ID of the transcript. This is an arbitrary ID that does not correspond to any official (Ensembl, NCBI...) transcript ID or external reference. |
Transcript ID
The official transcript ID (usually an Ensembl ID, e.g. ENST00000395565). |
Transcript name
The transcript name (e.g. MDK-202). |
Transcript biotype
The biotype of the transcript (as defined by Ensembl). |
ORFs
Display all the transcripts related to the entry. |
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| 2877 | ENSMUST00000140246 | Tmem43-202 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 1064408 | ENSMUST00000205954 | Tmem43-205 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 2771 | ENSMUST00000032183 | Tmem43-201 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 576708 | ENSMUST00000153179 | Tmem43-204 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 3159530 | UNKNOWN_TRANSCRIPT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 207818 | ENSMUST00000144246 | Tmem43-203 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ORFs
59 ORFs
5 known transcripts
78 ORF to known transcript associations
|
MetamORF ORF ID The MetamORF ID of the ORF. This is an unique ID referring to the ORF. |
ORF Length
The genomic length of the ORF (in bp). This length is defined as the sum of the lengths of each exon constituting the ORF (thus excluding its eventual introns) and includes both the start and the stop codons. |
Nucleic sequence The nucleic sequence of the ORF. |
Amino acid sequence The amino acid sequence of the ORF. |
Start codon
The start codon sequence of the ORF. |
ORF annotations
A comma-separated list of all the annotations computed by our algorithm for the ORF. This list includes the annotations computed for the ORF for all transcripts. See the section dedicated to ORF annotations in the advanced documentation for more details regarding the nomenclature we use. |
Cell types
A comma-separated list of all the cell types in which the ORF has already been identified. |
Transcripts
Display all the transcripts related to the entry. |
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| 3180 | 111 |
GTG... |
VVS... |
GTG |
Intronic sORF |
BMDC,
E14,
MEF,
R1E, Skin_tumor, Testis |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 68626 | 96 |
TTG... |
LSD... |
TTG |
Intronic sORF |
R1E, Testis | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 525391 | 30 |
CTG... |
LRS... |
CTG |
ncRNA sORF Upstream Intronic |
MEF,
Spleen_B_cell,
3T3
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3153 | 36 |
GTG... |
VEV... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
3T3,
B_cell,
Brain,
E14, MEF, Neutrophil, NSC, Skin_tumor |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 908645 | 39 |
ATT... |
IPV... |
ATT |
Alternative InCDS Overlapping sORF Intronic |
E14, BMDC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 582909 | 33 |
GTG... |
VRL... |
GTG |
Intronic sORF ncRNA Alternative InCDS Overlapping |
3T3, MEF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 201914 | 120 |
TTG... |
LQL... |
TTG |
ncRNA sORF Alternative Overlapping Upstream Intronic |
MEF,
B_cell,
Brain,
3T3 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 415434 | 57 |
CTG... |
LWQ... |
CTG |
Intronic sORF ncRNA Upstream |
3T3,
MEF,
Neutrophil,
BMDC, C2C12, B_cell, E14, Spleen_B_cell |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 585041 | 126 |
TTG... |
LAT... |
TTG |
InCDS Overlapping sORF |
3T3,
E14,
MEF
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 585693 | 102 |
ATG... |
MWT... |
ATG |
sORF Alternative InCDS Overlapping |
3T3,
BMDC,
E14, Glioma, Liver, MEF, MESC, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 580058 | 156 |
CTG... |
LRP... |
CTG |
Alternative Overlapping sORF Upstream Intronic |
MEF, 3T3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 579706 | 33 |
ATG... |
MCE... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
3T3,
Brain,
E14,
MEF, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 525548 | 33 |
CTG... |
LSP... |
CTG |
ncRNA sORF Alternative InCDS Overlapping Intronic |
3T3,
MEF,
Spleen_B_cell,
Brain |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 70091 | 60 |
GTG... |
VKL... |
GTG |
Intronic sORF |
MEF,
R1E,
Testis
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 582073 | 36 |
GTG... |
VMC... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
3T3,
BMDC,
Brain,
MEF, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 201385 | 39 |
CTG... |
LAG... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
3T3,
Brain,
E14,
MEF, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 907742 | 63 |
ATT... |
IPS... |
ATT |
Intronic sORF Alternative Overlapping Upstream |
BMDC, E14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 197098 | 84 |
CTG... |
LDS... |
CTG |
sORF Upstream ncRNA Intronic |
B_cell,
Brain,
E14,
Spleen_B_cell, MEF, Neutrophil, v6-5, 3T3 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3102 | 33 |
ATG... |
MTL... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BMDC,
Brain,
E14,
Skin_tumor |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 208000 | 39 |
ATG... |
MTL... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
3T3,
BMDC,
Brain,
E14, Glioma, Liver, MEF, MESC, Spleen_B_cell |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 584256 | 192 |
CTG... |
LRP... |
CTG |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
3T3,
B_cell,
MEF
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 204136 | 51 |
TTG... |
LQR... |
TTG |
InCDS Overlapping sORF Intronic |
3T3,
Brain,
MEF,
BMDC |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 196048 | 114 |
TTG... |
LSC... |
TTG |
Alternative sORF Upstream |
Brain, MEF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 587193 | 63 |
GTG... |
VKT... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
3T3,
BMDC,
Brain,
E14, MEF, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1514431 | 45 |
TTG... |
LHG... |
TTG |
Downstream Overlapping sORF |
NSC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 911227 | 180 |
AGG... |
RSW... |
AGG |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
BMDC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 911241 | 99 |
ATT... |
IPS... |
ATT |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
BMDC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 910550 | 171 |
ATT... |
IPR... |
ATT |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
BMDC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 907801 | 144 |
AGG... |
RSW... |
AGG |
Intronic sORF |
BMDC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 209419 | 156 |
TTG... |
LQL... |
TTG |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
3T3,
B_cell,
Brain,
E14, MEF, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3202 | 120 |
CTG... |
LSL... |
CTG |
Intronic sORF |
BMDC,
MEF,
R1E,
Skin_tumor, Testis |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 68379 | 42 |
GTG... |
VEM... |
GTG |
Intronic sORF |
R1E, Testis | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 199683 | 42 |
CTG... |
LLA... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
3T3,
BMDC,
Brain,
MEF, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3001 | 108 |
GTG... |
VSP... |
GTG |
Intronic sORF |
BMDC,
MEF,
R1E,
Skin_tumor, Testis |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 910554 | 87 |
ATA... |
IEQ... |
ATA |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
BMDC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1248453 | 63 |
ATT... |
IPP... |
ATT |
InCDS Overlapping sORF |
E14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 579409 | 39 |
CTG... |
LDG... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
3T3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1688177 | 66 |
CTG... |
LSI... |
CTG |
ncRNA sORF Intronic |
MEF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 525311 | 36 |
CTG... |
LTQ... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
MEF, Spleen_B_cell | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 909692 | 75 |
ACG... |
TRS... |
ACG |
Intronic sORF |
BMDC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2876 | 60 |
CTG... |
LVH... |
CTG |
Intronic sORF |
R1E, Skin_tumor | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3036 | 69 |
CTG... |
LTG... |
CTG |
Intronic sORF |
MEF, Skin_tumor | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 575859 | 30 |
TTG... |
LTR... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
3T3, MEF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 192547 | 60 |
ATG... |
MDG... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
B_cell,
Brain,
NSC
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 908823 | 135 |
ATT... |
IPR... |
ATT |
Intronic sORF |
BMDC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3287 | 150 |
CTG... |
LKT... |
CTG |
Intronic sORF |
BMDC,
E14,
R1E,
Skin_tumor, Testis |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 196580 | 33 |
CTG... |
LSS... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
Brain,
E14,
MEF,
NSC, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 68464 | 54 |
CTG... |
LRR... |
CTG |
Intronic sORF |
E14,
MEF,
R1E,
Testis |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 198843 | 48 |
CTG... |
LWL... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
3T3,
BMDC,
Brain,
MEF, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2770 | 81 |
ATG... |
MGP... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Brain,
MEF,
Skin_tumor
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 576707 | 63 |
GTG... |
VAD... |
GTG |
Intronic sORF ncRNA |
3T3, MEF | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 587214 | 138 |
TTG... |
LTE... |
TTG |
InCDS Overlapping sORF |
3T3,
E14,
MEF
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 207817 | 45 |
CTG... |
LSI... |
CTG |
ncRNA sORF |
3T3,
B_cell,
Brain,
E14, MEF, NSC, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1248032 | 51 |
ATA... |
IEQ... |
ATA |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
E14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 208900 | 66 |
ATG... |
MWR... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
3T3,
Brain,
Glioma,
Liver, MEF, MESC, Neutrophil, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 578520 | 132 |
TTG... |
LRL... |
TTG |
sORF Upstream |
3T3, Neutrophil | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 575291 | 39 |
TTG... |
LVM... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
3T3,
BMDC,
Brain,
MEF, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 586506 | 156 |
TTG... |
LST... |
TTG |
InCDS Overlapping sORF |
3T3,
E14,
MEF
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1249485 | 96 |
ATT... |
IPP... |
ATT |
InCDS Overlapping sORF |
E14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Export data