Gene
Gene
ID CARD
ID
HGNC:6399
Aliases
ENSG00000025800
FLJ11249,
HGNC:6399,
IPOA7
KPNA6,
KPNA7,
MGC17918
NCBI:23633,
OFF:KPNA6
Chromosome
1
Transcripts
96 ORFs
4 known transcripts
99 ORF to known transcript associations
MetamORF transcript ID The MetamORF ID of the transcript. This is an arbitrary ID that does not correspond to any official (Ensembl, NCBI...) transcript ID or external reference. |
Transcript ID
The official transcript ID (usually an Ensembl ID, e.g. ENST00000395565). |
Transcript name
The transcript name (e.g. MDK-202). |
Transcript biotype
The biotype of the transcript (as defined by Ensembl). |
ORFs
Display all the transcripts related to the entry. |
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288059 | ENST00000446515 | KPNA6-202 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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4496 | ENST00000471599 | KPNA6-204 | nonsense_mediated_decay | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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87674 | ENST00000373625 | KPNA6-201 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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288010 | ENST00000469790 | KPNA6-203 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3400307 | UNKNOWN_TRANSCRIPT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
ORFs
96 ORFs
4 known transcripts
99 ORF to known transcript associations
MetamORF ORF ID The MetamORF ID of the ORF. This is an unique ID referring to the ORF. |
ORF Length
The genomic length of the ORF (in bp). This length is defined as the sum of the lengths of each exon constituting the ORF (thus excluding its eventual introns) and includes both the start and the stop codons. |
Nucleic sequence The nucleic sequence of the ORF. |
Amino acid sequence The amino acid sequence of the ORF. |
Start codon
The start codon sequence of the ORF. |
ORF annotations
A comma-separated list of all the annotations computed by our algorithm for the ORF. This list includes the annotations computed for the ORF for all transcripts. See the section dedicated to ORF annotations in the advanced documentation for more details regarding the nomenclature we use. |
Cell types
A comma-separated list of all the cell types in which the ORF has already been identified. |
Transcripts
Display all the transcripts related to the entry. |
||||||||||||||||||||||||||||||||
636385 | 39 |
CTG... |
LGH... |
CTG |
sORF |
Blood,
HeLa,
MDA-MB-231,
THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288140 | 84 |
ATG... |
MDW... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Blood,
Brain,
Brain_tumor,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2053323 | 66 |
ATG... |
MQS... |
ATG |
sORF |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288112 | 30 |
CTG... |
LLA... |
CTG |
sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2547320 | 156 |
CTG... |
LFS... |
CTG |
sORF |
HEK293, hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288088 | 33 |
ATG... |
MAP... |
ATG |
sORF |
BJ,
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
904374 | 75 |
AGG... |
RSQ... |
AGG |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1137413 | 75 |
CTG... |
LGP... |
CTG |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407860 | 108 |
TTT... |
FGV... |
TTT |
Alternative Downstream NMD sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
904421 | 174 |
GTA... |
VMD... |
GTA |
Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4495 | 129 |
GTG... |
VLI... |
GTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Flp-In_T-REx-293, guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2325833 | 30 |
ATG... |
MIT... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824565 | 51 |
CTG... |
LIV... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824659 | 33 |
GTG... |
VRV... |
GTG |
Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
884300 | 81 |
AGG... |
RSQ... |
AGG |
InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102517 | 150 |
GTG... |
VAL... |
GTG |
Downstream NMD sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
884344 | 42 |
CAG... |
QVP... |
CAG |
InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824559 | 93 |
TTG... |
LVL... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4522 | 219 |
CTG... |
LVS... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407791 | 84 |
CTA... |
LNP... |
CTA |
ncRNA sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102534 | 123 |
CTG... |
LRL... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
hES, HFF, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407845 | 195 |
CCC... |
PLC... |
CCC |
Downstream NMD sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824422 | 30 |
CTG... |
LGT... |
CTG |
sORF |
BJ,
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2325662 | 51 |
ATG... |
MKL... |
ATG |
sORF InCDS NMD Overlapping |
MDA-MB-231,
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3400306 | 561 |
ATG... |
MET... |
ATG |
CDS NMD |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824544 | 48 |
TTG... |
LRE... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824633 | 30 |
CTG... |
LAL... |
CTG |
Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1137443 | 60 |
TTG... |
LES... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3400312 | 1626 |
ATG... |
MKS... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
904454 | 81 |
GTC... |
VNP... |
GTC |
Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2325756 | 111 |
CTG... |
LYC... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4549 | 78 |
TTG... |
LSF... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407780 | 42 |
CGA... |
RAD... |
CGA |
Alternative NMD Overlapping sORF Upstream |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2258194 | 189 |
ATG... |
MQS... |
ATG |
sORF Alternative Downstream NMD |
MDA-MB-231,
Brain_tumor,
HEK293, HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824548 | 42 |
TTG... |
LVS... |
TTG |
Downstream NMD sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824649 | 72 |
ATG... |
MIQ... |
ATG |
Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824546 | 36 |
CTG... |
LRW... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102508 | 183 |
TTG... |
LLT... |
TTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
904372 | 135 |
TCT... |
SPL... |
TCT |
sORF |
HeLa,
Jurkat,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824684 | 60 |
CTG... |
LGG... |
CTG |
Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
904414 | 213 |
TCA... |
SLG... |
TCA |
Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288138 | 102 |
TTG... |
LCK... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4498 | 126 |
TTG... |
LIE... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
407849 | 108 |
CGA... |
RRL... |
CGA |
Alternative Downstream NMD sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
636301 | 39 |
CTG... |
LPC... |
CTG |
sORF InCDS NMD Overlapping |
Blood,
MDA-MB-231,
THP-1,
HEK293 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824672 | 93 |
CTG... |
LFS... |
CTG |
Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
247434 | 36 |
CTG... |
LLA... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
HAP1, HEK293, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824670 | 102 |
ATG... |
MPA... |
ATG |
sORF Downstream |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824601 | 30 |
ATG... |
MEP... |
ATG |
Alternative Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1137361 | 54 |
CTG... |
LPP... |
CTG |
Alternative NMD Overlapping sORF Upstream |
BJ,
HEK293,
HeLa,
hES, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824561 | 57 |
CTG... |
LLG... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824555 | 99 |
CTG... |
LSL... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824563 | 66 |
CTG... |
LDH... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824574 | 42 |
ATG... |
MGV... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2088379 | 36 |
CTG... |
LPE... |
CTG |
sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824668 | 99 |
CTG... |
LNP... |
CTG |
Alternative Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4547 | 186 |
TTG... |
LDK... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HAP1, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824598 | 54 |
TTG... |
LPG... |
TTG |
Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
87673 | 36 |
TTG... |
LWP... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
636329 | 36 |
TTG... |
LPR... |
TTG |
sORF |
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231,
THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4551 | 81 |
CTG... |
LAP... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824690 | 30 |
TTG... |
LKE... |
TTG |
Alternative Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288009 | 75 |
TTG... |
LAV... |
TTG |
ncRNA sORF |
LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288017 | 69 |
GTG... |
VCI... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
hES,
LCL,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1731433 | 48 |
ATG... |
MKK... |
ATG |
sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824661 | 168 |
GTG... |
VYL... |
GTG |
Alternative Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824677 | 45 |
ATG... |
MAW... |
ATG |
Alternative Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
247436 | 81 |
ATG... |
MPH... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF InCDS Overlapping |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, BJ, Blood, HAP1, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824652 | 72 |
CTG... |
LLF... |
CTG |
Alternative Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824551 | 33 |
CTG... |
LSV... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
904410 | 42 |
TGG... |
WSH... |
TGG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824657 | 33 |
CTG... |
LGY... |
CTG |
Alternative Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
884325 | 114 |
GTA... |
VQG... |
GTA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102541 | 36 |
GTG... |
VAQ... |
GTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102506 | 210 |
CTG... |
LGC... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
guo_2014, HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824665 | 129 |
CTG... |
LTS... |
CTG |
Alternative Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102510 | 180 |
CTG... |
LTV... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
904135 | 84 |
GCC... |
AAE... |
GCC |
Alternative NMD Overlapping sORF Upstream |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102532 | 135 |
CTG... |
LEN... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3400309 | 965 |
CGG... |
RRN... |
CGG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
884340 | 54 |
AGA... |
RSG... |
AGA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2325766 | 63 |
ATG... |
MLA... |
ATG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1137363 | 45 |
TTG... |
LPP... |
TTG |
Alternative NMD Overlapping sORF Upstream |
BJ,
HEK293,
hES,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288058 | 87 |
TTG... |
LFA... |
TTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1137357 | 66 |
CTG... |
LPL... |
CTG |
Alternative NMD Overlapping sORF Upstream |
BJ,
HEK293,
HeLa,
hES, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3223672 | 69 |
TTG... |
LPG... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
904442 | 117 |
CTT... |
LGE... |
CTT |
Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
102515 | 156 |
GTG... |
VQV... |
GTG |
Downstream NMD sORF |
Brain,
guo_2014,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
247438 | 60 |
CTG... |
LSR... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824655 | 57 |
CTG... |
LQG... |
CTG |
Alternative Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824663 | 153 |
CTG... |
LPS... |
CTG |
Alternative Downstream sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288080 | 36 |
CTG... |
LMA... |
CTG |
sORF |
BJ,
HEK293,
LCL,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1824433 | 36 |
CTG... |
LEI... |
CTG |
sORF |
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
884332 | 66 |
GAA... |
EPL... |
GAA |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
636364 | 141 |
TTG... |
LPS... |
TTG |
sORF |
HEK293,
hES,
THP-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1137359 | 60 |
CTG... |
LKL... |
CTG |
Alternative NMD Overlapping sORF Upstream |
BJ,
HEK293,
HeLa,
hES, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Export data