Gene
Gene
ID CARD
ID
HGNC:28720
Aliases
C11orf49
ENSG00000149179,
FLJ22210,
HGNC:28720
MGC4707,
NCBI:79096,
OFF:C11orf49
Chromosome
11
Transcripts
99 ORFs
15 known transcripts
91 ORF to known transcript associations
MetamORF transcript ID The MetamORF ID of the transcript. This is an arbitrary ID that does not correspond to any official (Ensembl, NCBI...) transcript ID or external reference. |
Transcript ID
The official transcript ID (usually an Ensembl ID, e.g. ENST00000395565). |
Transcript name
The transcript name (e.g. MDK-202). |
Transcript biotype
The biotype of the transcript (as defined by Ensembl). |
ORFs
Display all the transcripts related to the entry. |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3244 | ENST00000624693 | C11orf49-223 | TEC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101749 | ENST00000534581 | C11orf49-222 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101737 | ENST00000378618 | C11orf49-203 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906569 | ENST00000527268 | C11orf49-212 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306710 | UNKNOWN_TRANSCRIPT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101740 | ENST00000527784 | C11orf49-214 | nonsense_mediated_decay | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
284710 | ENST00000526827 | C11orf49-210 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
941138 | ENST00000378615 | C11orf49-202 | protein_coding | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
916106 | ENST00000533124 | C11orf49-220 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105771 | ENST00000527234 | C11orf49-211 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1316611 | ENST00000528488 | C11orf49-215 | nonsense_mediated_decay | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101734 | ENST00000525279 | C11orf49-206 | nonsense_mediated_decay | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3552488 | ENST00000532633 | C11orf49-218 | nonsense_mediated_decay | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
941937 | ENST00000529980 | C11orf49-216 | processed_transcript | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3552494 | ENST00000543718 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3552499 | ENST00000527667 | C11orf49-213 | nonsense_mediated_decay | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
ORFs
99 ORFs
15 known transcripts
91 ORF to known transcript associations
MetamORF ORF ID The MetamORF ID of the ORF. This is an unique ID referring to the ORF. |
ORF Length
The genomic length of the ORF (in bp). This length is defined as the sum of the lengths of each exon constituting the ORF (thus excluding its eventual introns) and includes both the start and the stop codons. |
Nucleic sequence The nucleic sequence of the ORF. |
Amino acid sequence The amino acid sequence of the ORF. |
Start codon
The start codon sequence of the ORF. |
ORF annotations
A comma-separated list of all the annotations computed by our algorithm for the ORF. This list includes the annotations computed for the ORF for all transcripts. See the section dedicated to ORF annotations in the advanced documentation for more details regarding the nomenclature we use. |
Cell types
A comma-separated list of all the cell types in which the ORF has already been identified. |
Transcripts
Display all the transcripts related to the entry. |
||||||||||||||||||||||||||||||||
101771 | 63 |
TTG... |
LPD... |
TTG |
sORF |
BJ,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101779 | 117 |
CTG... |
LPS... |
CTG |
sORF |
BJ,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101748 | 195 |
CTG... |
LDS... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101757 | 138 |
GTG... |
VIV... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101736 | 102 |
CTG... |
LGS... |
CTG |
Alternative Overlapping sORF Upstream |
BJ,
Brain,
HAP1,
HEK293, HeLa, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101761 | 90 |
TTG... |
LGG... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906568 | 267 |
GTA... |
VCQ... |
GTA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306733 | 186 |
ATG... |
MLS... |
ATG |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820561 | 111 |
CTG... |
LPE... |
CTG |
ncRNA sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306730 | 150 |
ATG... |
MLS... |
ATG |
CDS NMD sORF |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101777 | 156 |
CTG... |
LVN... |
CTG |
sORF |
Brain,
HEK293,
HeLa,
hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
941137 | 168 |
ATG... |
MEL... |
ATG |
sORF Alternative InCDS Overlapping |
Brain,
HEK293,
hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306712 | 255 |
ATG... |
MLS... |
ATG |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101742 | 60 |
CTG... |
LSP... |
CTG |
InCDS NMD Overlapping sORF |
BJ,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820572 | 186 |
GTG... |
VNN... |
GTG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
284712 | 33 |
ATG... |
MLP... |
ATG |
sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
941140 | 147 |
CTG... |
LNI... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Brain,
HEK293,
hES,
MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306727 | 198 |
ATG... |
MEL... |
ATG |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906566 | 84 |
TAC... |
YME... |
TAC |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1505491 | 33 |
GTG... |
VPA... |
GTG |
InCDS NMD Overlapping sORF |
BJ,
HeLa,
MDA-MB-231,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101769 | 36 |
CTG... |
LEN... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
guo_2014,
HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820588 | 39 |
TTG... |
LSR... |
TTG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101755 | 162 |
CTG... |
LSG... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
916108 | 186 |
CAC... |
HIL... |
CAC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
284714 | 33 |
TTG... |
LCS... |
TTG |
ncRNA sORF |
HeLa, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
937227 | 57 |
TTG... |
LQL... |
TTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
BJ,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2327051 | 144 |
CTG... |
LPW... |
CTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906579 | 138 |
GCG... |
AVS... |
GCG |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906585 | 267 |
ACT... |
TRS... |
ACT |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101751 | 186 |
GTG... |
VAA... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
937253 | 36 |
GTG... |
VES... |
GTG |
ncRNA sORF |
Brain | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
916105 | 201 |
GTA... |
VCQ... |
GTA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820559 | 120 |
ATG... |
MSS... |
ATG |
ncRNA sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
937260 | 45 |
CTG... |
LET... |
CTG |
sORF |
Blood,
Brain,
MDA-MB-231,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820578 | 111 |
CTG... |
LLS... |
CTG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2327047 | 183 |
TTG... |
LCR... |
TTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2688784 | 165 |
CTG... |
LAS... |
CTG |
ncRNA sORF |
hES, RPE-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2327049 | 165 |
GTG... |
VGS... |
GTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101744 | 69 |
GTG... |
VCQ... |
GTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1987961 | 87 |
TTG... |
LLF... |
TTG |
InCDS NMD Overlapping sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
105770 | 183 |
CTG... |
LSP... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306736 | 205 |
CCA... |
PQ*... |
CCA |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820565 | 39 |
ATG... |
MRT... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF ncRNA |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2327056 | 123 |
CTG... |
LPT... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
HeLa,
hES,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820576 | 45 |
ATG... |
MAC... |
ATG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306721 | 150 |
ATG... |
MLS... |
ATG |
sORF CDS NMD |
HFF, | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3243 | 54 |
GTG... |
VDG... |
GTG |
sORF |
BJ,
Brain,
guo_2014,
HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101739 | 72 |
TTG... |
LKP... |
TTG |
Alternative NMD Overlapping sORF Upstream |
BJ,
Brain,
HEK293,
HeLa, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1316610 | 135 |
GTG... |
VGA... |
GTG |
Alternative NMD Overlapping sORF Upstream |
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820584 | 36 |
GTG... |
VLR... |
GTG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306742 | 825 |
ATG... |
MLS... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101733 | 126 |
ATG... |
MAT... |
ATG |
Alternative NMD Overlapping sORF Upstream |
BJ,
HAP1,
HEK293,
HeLa, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906583 | 33 |
GAA... |
ENL... |
GAA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906587 | 255 |
CCA... |
PVQ... |
CCA |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101765 | 63 |
GTG... |
VEA... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906589 | 42 |
AGT... |
SDG... |
AGT |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101753 | 165 |
CTG... |
LLS... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
941135 | 267 |
CTG... |
LSP... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306718 | 150 |
ATG... |
MLS... |
ATG |
sORF CDS NMD |
HFF, | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
937229 | 42 |
ATG... |
MSS... |
ATG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
BJ,
Blood,
Brain,
Brain_tumor, HEK293, HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906573 | 252 |
CAC... |
HIL... |
CAC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820574 | 120 |
GTG... |
VNG... |
GTG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101746 | 60 |
CTG... |
LLE... |
CTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906575 | 237 |
TTC... |
FSF... |
TTC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306745 | 1014 |
ATG... |
MLS... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
937251 | 66 |
ATG... |
MDS... |
ATG |
ncRNA sORF |
Brain, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1139274 | 162 |
TTG... |
LPG... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293,
hES,
MDA-MB-231,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293619 | 81 |
ATG... |
MLP... |
ATG |
sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
284718 | 48 |
CTG... |
LPS... |
CTG |
ncRNA sORF |
HeLa,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906577 | 153 |
CTG... |
LWA... |
CTG |
sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306739 | 582 |
AGG... |
RVS... |
AGG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
284709 | 39 |
CTG... |
LEM... |
CTG |
sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
937235 | 63 |
CTG... |
LLD... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
HeLa,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906564 | 168 |
CCC... |
PYR... |
CCC |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293617 | 87 |
CTG... |
LEM... |
CTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1724621 | 63 |
ATG... |
MPG... |
ATG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
941936 | 42 |
TTG... |
LPS... |
TTG |
ncRNA sORF |
Brain, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306748 | 981 |
ATG... |
MLS... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2327054 | 72 |
GTG... |
VIG... |
GTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2313558 | 84 |
TTG... |
LPA... |
TTG |
sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306724 | 309 |
ATG... |
MLS... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820586 | 33 |
CTG... |
LRP... |
CTG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820580 | 102 |
CTG... |
LAL... |
CTG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101767 | 51 |
CTG... |
LFY... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306709 | 12 |
CTG... |
LEL... |
CTG |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
293621 | 90 |
CTG... |
LLD... |
CTG |
sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820567 | 36 |
TTG... |
LSK... |
TTG |
ncRNA sORF |
HeLa, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906581 | 87 |
TGT... |
CAH... |
TGT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3306715 | 150 |
ATG... |
MLS... |
ATG |
CDS NMD sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
937249 | 114 |
CTG... |
LPT... |
CTG |
ncRNA sORF |
Brain,
HeLa,
hES,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1301604 | 36 |
GCG... |
APS... |
GCG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
BJ | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101759 | 132 |
GTG... |
VPT... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101763 | 72 |
CTG... |
LEG... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101773 | 45 |
CTG... |
LMH... |
CTG |
sORF |
BJ,
Brain,
HEK293,
HeLa, hES, HFF, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101775 | 174 |
CTG... |
LAQ... |
CTG |
sORF |
Brain,
HEK293,
HeLa,
hES, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2683045 | 63 |
GTG... |
VPW... |
GTG |
NMD sORF Upstream |
RPE-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1820582 | 63 |
CTG... |
LTD... |
CTG |
sORF |
HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
284716 | 54 |
GTG... |
VWL... |
GTG |
ncRNA sORF |
HeLa,
LCL,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
906571 | 246 |
GAA... |
EHT... |
GAA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Export data