Gene
Gene
ID CARD
ID
NCBI:66317
Aliases
2700038L12Rik
2810418I05Rik,
ENSMUSG00000061559,
MGI:1917493
NCBI:66317,
OFF:Wdr61,
REC14
Wdr61
Chromosome
9
Transcripts
50 ORFs
7 known transcripts
98 ORF to known transcript associations
|
MetamORF transcript ID The MetamORF ID of the transcript. This is an arbitrary ID that does not correspond to any official (Ensembl, NCBI...) transcript ID or external reference. |
Transcript ID
The official transcript ID (usually an Ensembl ID, e.g. ENST00000395565). |
Transcript name
The transcript name (e.g. MDK-202). |
Transcript biotype
The biotype of the transcript (as defined by Ensembl). |
ORFs
Display all the transcripts related to the entry. |
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| 84533 | ENSMUST00000051822 | Wdr61-201 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 5910 | ENSMUST00000118771 | Wdr61-202 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 254437 | ENSMUST00000130368 | Wdr61-205 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 760383 | ENSMUST00000121204 | Wdr61-203 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 270372 | ENSMUST00000127451 | Wdr61-204 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 3049179 | UNKNOWN_TRANSCRIPT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 759431 | ENSMUST00000148494 | Wdr61-207 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 1269048 | ENSMUST00000144365 | Wdr61-206 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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ORFs
50 ORFs
7 known transcripts
98 ORF to known transcript associations
|
MetamORF ORF ID The MetamORF ID of the ORF. This is an unique ID referring to the ORF. |
ORF Length
The genomic length of the ORF (in bp). This length is defined as the sum of the lengths of each exon constituting the ORF (thus excluding its eventual introns) and includes both the start and the stop codons. |
Nucleic sequence The nucleic sequence of the ORF. |
Amino acid sequence The amino acid sequence of the ORF. |
Start codon
The start codon sequence of the ORF. |
ORF annotations
A comma-separated list of all the annotations computed by our algorithm for the ORF. This list includes the annotations computed for the ORF for all transcripts. See the section dedicated to ORF annotations in the advanced documentation for more details regarding the nomenclature we use. |
Cell types
A comma-separated list of all the cell types in which the ORF has already been identified. |
Transcripts
Display all the transcripts related to the entry. |
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| 763343 | 39 |
CTG... |
LCG... |
CTG |
Alternative sORF Upstream |
B_cell, Liver | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5909 | 105 |
GTG... |
VMR... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
3T3,
Skin_tumor,
Brain
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6220 | 102 |
ATG... |
MRG... |
ATG |
Alternative sORF Upstream InCDS Overlapping |
Glioma,
Liver,
MEF,
MESC, Skin_tumor, Brain |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 257815 | 87 |
ATG... |
MMP... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF Upstream |
B_cell,
E14,
Brain,
C2C12, BMDC, Liver, 3T3, R1E, Neutrophil, NSC, Spleen_B_cell |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 624134 | 45 |
CTG... |
LTP... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
3T3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 274315 | 93 |
TTG... |
LFP... |
TTG |
sORF Upstream |
3T3,
Brain,
MEF,
R1E, B_cell, E14, Liver, Neutrophil, NSC, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 627336 | 60 |
ATG... |
MLR... |
ATG |
InCDS Overlapping sORF Alternative |
3T3,
Liver,
MEF,
v6-5, Glioma, MESC |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 625813 | 57 |
TTG... |
LRS... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
MEF,
v6-5,
3T3,
Liver |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6445 | 153 |
GTG... |
VEP... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF Upstream |
3T3,
Liver,
Skin_tumor,
B_cell, Brain, E14, MEF, NSC, Spleen_B_cell, v6-5, Testis, R1E |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 255020 | 48 |
GTG... |
VVT... |
GTG |
Alternative sORF Upstream |
3T3,
Brain,
R1E,
Liver, MEF, NSC, Spleen_B_cell, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 261456 | 84 |
ATG... |
MPY... |
ATG |
sORF Alternative Upstream InCDS Overlapping |
Neutrophil,
NSC,
Spleen_B_cell,
3T3, R1E, B_cell, Brain |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 268008 | 72 |
ATG... |
MLE... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Brain,
E14,
v6-5
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 625109 | 36 |
TTG... |
LEA... |
TTG |
sORF Upstream |
3T3, R1E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 762587 | 33 |
CTG... |
LMG... |
CTG |
Intronic sORF InCDS Overlapping |
B_cell, Brain | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1114816 | 45 |
TTG... |
LRS... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF Intronic |
E14,
MEF,
NSC,
v6-5, R1E |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1274204 | 81 |
CTG... |
LTP... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
R1E, E14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 436375 | 33 |
CTG... |
LDD... |
CTG |
Alternative sORF Upstream |
R1E,
Liver,
Spleen_B_cell,
v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 923342 | 63 |
GTG... |
VVS... |
GTG |
Alternative sORF Upstream |
BMDC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 626201 | 36 |
ATG... |
MMY... |
ATG |
InCDS Overlapping sORF |
3T3, Liver | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1274184 | 105 |
TTG... |
LAG... |
TTG |
Intronic sORF |
E14, R1E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 268729 | 42 |
ATG... |
MVS... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF Upstream |
Liver,
Glioma,
MEF,
MESC, Brain |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1033811 | 204 |
TTG... |
LKI... |
TTG |
CDS sORF |
Brain | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 626592 | 84 |
ATG... |
MQD... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
3T3,
Glioma,
Liver,
MEF, MESC |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 624472 | 30 |
ATG... |
MVV... |
ATG |
Alternative sORF Upstream |
B_cell, 3T3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 762394 | 75 |
TTG... |
LTF... |
TTG |
Intronic sORF |
B_cell, Liver | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 269324 | 69 |
TTG... |
LEQ... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Brain,
E14,
v6-5
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 620087 | 30 |
CTG... |
LGV... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF Intronic |
3T3, R1E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 258911 | 90 |
ATG... |
MMM... |
ATG |
sORF Alternative InCDS Overlapping Upstream |
Brain,
Liver,
B_cell, 3T3, Glioma, MEF, MESC, R1E, Neutrophil, NSC, Spleen_B_cell |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1114090 | 42 |
TTG... |
LGC... |
TTG |
Intronic sORF Alternative InCDS Overlapping |
R1E, v6-5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1114247 | 33 |
CTG... |
LMT... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF Intronic |
NSC,
v6-5,
E14,
R1E |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6079 | 54 |
CTG... |
LGL... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF Upstream |
3T3,
Liver,
Skin_tumor,
E14, MEF, NSC, Spleen_B_cell, v6-5, R1E, Brain, Testis, B_cell |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 264375 | 69 |
TTG... |
LPG... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF Upstream |
Brain,
E14,
Spleen_B_cell,
3T3, R1E, B_cell |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1113936 | 48 |
ATG... |
MLR... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF Intronic |
E14,
MEF,
NSC,
v6-5, R1E |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1571487 | 48 |
CTG... |
LWT... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Brain | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 437569 | 39 |
TTG... |
LKQ... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
3T3,
BMDC,
Brain,
Liver, E14, Spleen_B_cell |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1829244 | 72 |
GTG... |
VLN... |
GTG |
Intronic sORF |
R1E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 922791 | 87 |
CTG... |
LYG... |
CTG |
sORF Upstream |
BMDC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 265303 | 30 |
CTG... |
LGD... |
CTG |
sORF Upstream Alternative InCDS Overlapping |
Brain, 3T3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 990277 | 60 |
CTG... |
LTD... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Liver | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 626595 | 99 |
CTG... |
LVL... |
CTG |
sORF Upstream |
B_cell,
Liver,
NSC,
v6-5, 3T3, MEF, R1E |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1524504 | 60 |
CTG... |
LTD... |
CTG |
sORF |
NSC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 924020 | 99 |
CTG... |
LCG... |
CTG |
sORF Upstream |
BMDC, E14 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 924881 | 102 |
GTG... |
VLC... |
GTG |
sORF Upstream |
BMDC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 759430 | 30 |
ATG... |
MGN... |
ATG |
InCDS Overlapping sORF Intronic |
Glioma,
Liver,
MEF,
MESC, B_cell |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 270371 | 96 |
GTG... |
VLF... |
GTG |
sORF Upstream |
3T3,
MEF,
R1E,
B_cell, Brain, E14, Liver, Neutrophil, NSC, v6-5 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1524424 | 54 |
ATG... |
MAT... |
ATG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
NSC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 626555 | 54 |
CTG... |
LES... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
3T3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1831031 | 30 |
ATG... |
MTL... |
ATG |
Intronic sORF |
R1E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1828673 | 93 |
CTG... |
LSG... |
CTG |
Intronic sORF |
R1E | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 625647 | 87 |
CTG... |
LTP... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
3T3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Export data