Gene
Gene
ID CARD
ID
HGNC:28409
Aliases
DCUN1D5
ENSG00000137692,
FLJ32431,
HGNC:28409
MGC2714,
NCBI:84259,
OFF:DCUN1D5
Chromosome
11
Transcripts
75 ORFs
8 known transcripts
78 ORF to known transcript associations
|
MetamORF transcript ID The MetamORF ID of the transcript. This is an arbitrary ID that does not correspond to any official (Ensembl, NCBI...) transcript ID or external reference. |
Transcript ID
The official transcript ID (usually an Ensembl ID, e.g. ENST00000395565). |
Transcript name
The transcript name (e.g. MDK-202). |
Transcript biotype
The biotype of the transcript (as defined by Ensembl). |
ORFs
Display all the transcripts related to the entry. |
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| 103731 | ENST00000527779 | DCUN1D5-205 | nonsense_mediated_decay | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 6367 | ENST00000525420 | DCUN1D5-202 | nonsense_mediated_decay | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 6376 | ENST00000529076 | DCUN1D5-206 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 3317372 | UNKNOWN_TRANSCRIPT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 6358 | ENST00000527576 | DCUN1D5-204 | nonsense_mediated_decay | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 104718 | ENST00000260247 | DCUN1D5-201 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 7489 | ENST00000531543 | DCUN1D5-209 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 1138316 | ENST00000529294 | DCUN1D5-208 | nonsense_mediated_decay | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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| 1823562 | ENST00000529281 | DCUN1D5-207 | nonsense_mediated_decay | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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ORFs
75 ORFs
8 known transcripts
78 ORF to known transcript associations
|
MetamORF ORF ID The MetamORF ID of the ORF. This is an unique ID referring to the ORF. |
ORF Length
The genomic length of the ORF (in bp). This length is defined as the sum of the lengths of each exon constituting the ORF (thus excluding its eventual introns) and includes both the start and the stop codons. |
Nucleic sequence The nucleic sequence of the ORF. |
Amino acid sequence The amino acid sequence of the ORF. |
Start codon
The start codon sequence of the ORF. |
ORF annotations
A comma-separated list of all the annotations computed by our algorithm for the ORF. This list includes the annotations computed for the ORF for all transcripts. See the section dedicated to ORF annotations in the advanced documentation for more details regarding the nomenclature we use. |
Cell types
A comma-separated list of all the cell types in which the ORF has already been identified. |
Transcripts
Display all the transcripts related to the entry. |
||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3317377 | 255 |
ATG... |
MPV... |
ATG |
CDS NMD sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 636742 | 270 |
CTG... |
LSA... |
CTG |
Alternative NMD Overlapping sORF Upstream |
HEK293,
HEK293T,
HeLa,
hES, MM1S, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912657 | 63 |
GGA... |
GRM... |
GGA |
Alternative Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 290133 | 171 |
GTG... |
VRT... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HEK293T, HeLa, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7491 | 102 |
ATG... |
MIF... |
ATG |
sORF InCDS Overlapping |
Blood,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1, Brain_tumor, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3317386 | 93 |
ATG... |
MPV... |
ATG |
CDS NMD sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1049078 | 30 |
ATG... |
MNM... |
ATG |
sORF Alternative InCDS Overlapping |
HFF,
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912651 | 54 |
ATA... |
IFR... |
ATA |
NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3317374 | 714 |
ATG... |
MPV... |
ATG |
CDS |
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912672 | 171 |
GTG... |
VAA... |
GTG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 636749 | 291 |
GTG... |
VTG... |
GTG |
Alternative NMD Overlapping sORF Upstream |
HEK293,
HEK293T,
HeLa,
hES, MM1S, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3317380 | 129 |
ATT... |
IIM... |
ATT |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1728607 | 30 |
TTG... |
LIL... |
TTG |
Downstream NMD sORF |
Blood, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912653 | 42 |
AAA... |
KSY... |
AAA |
Alternative Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6360 | 51 |
ATG... |
MLI... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, LCL, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1824718 | 153 |
ATG... |
MLI... |
ATG |
Alternative Downstream Overlapping sORF |
HeLa,
Brain_tumor,
HEK293,
HFF, |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 290121 | 51 |
CTG... |
LFF... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912668 | 60 |
AAG... |
KCL... |
AAG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912662 | 63 |
GCT... |
AES... |
GCT |
Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912675 | 183 |
AAA... |
KSP... |
AAA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 636751 | 300 |
TTG... |
LLA... |
TTG |
Alternative NMD Overlapping sORF Upstream |
HEK293,
HEK293T,
HeLa,
MM1S, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7488 | 69 |
TTG... |
LGG... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 482991 | 42 |
ATG... |
MVQ... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HEK293T,
HeLa,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3200877 | 228 |
CCA... |
PPA... |
CCA |
ncRNA sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408820 | 159 |
CGC... |
RSV... |
CGC |
ncRNA sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1131746 | 30 |
GTG... |
VLN... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6375 | 48 |
CTG... |
LLL... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912647 | 138 |
GAT... |
DQR... |
GAT |
Alternative Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1728609 | 30 |
CTG... |
LHR... |
CTG |
Downstream NMD sORF |
Blood,
HEK293,
hES,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1728611 | 54 |
GTG... |
VTA... |
GTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1318547 | 54 |
CTG... |
LAW... |
CTG |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Flp-In_T-REx-293,
HEK293,
HeLa,
hES |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6378 | 57 |
CTG... |
LAT... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HEK293, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 531608 | 96 |
CTG... |
LPG... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HFF,
MDA-MB-231,
RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 103733 | 90 |
CTG... |
LLG... |
CTG |
NMD sORF Alternative Downstream |
HEK293,
HeLa,
hES
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 915091 | 99 |
ATA... |
IFR... |
ATA |
InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3317371 | 586 |
CTA... |
LLQ... |
CTA |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3317392 | 204 |
ATG... |
MPV... |
ATG |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912664 | 33 |
GCA... |
AGN... |
GCA |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 636744 | 201 |
CTG... |
LPR... |
CTG |
Alternative NMD sORF Upstream |
BJ,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 104717 | 33 |
TTG... |
LVL... |
TTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1297989 | 57 |
ATG... |
MIF... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HEK293T | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408818 | 189 |
AAG... |
KRK... |
AAG |
ncRNA sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 290123 | 30 |
CTG... |
LSL... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912645 | 126 |
CTT... |
LDI... |
CTT |
Alternative Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3317389 | 216 |
ATG... |
MPV... |
ATG |
sORF |
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 483307 | 75 |
GTG... |
VER... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1301709 | 192 |
AAG... |
KTT... |
AAG |
ncRNA sORF |
BJ | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912643 | 108 |
AAA... |
KSM... |
AAA |
Alternative Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 290116 | 33 |
ATG... |
MMK... |
ATG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HAP1, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1318549 | 198 |
GTG... |
VKK... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293, HeLa | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 531610 | 105 |
CTG... |
LPT... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HFF,
MDA-MB-231,
RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408822 | 207 |
GTG... |
VEL... |
GTG |
Alternative NMD sORF Upstream |
BJ,
HCT116,
HEK293,
HEK293T, HeLa, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912655 | 39 |
TTC... |
FIT... |
TTC |
Alternative Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6357 | 48 |
CTG... |
LIL... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Blood,
HAP1,
HEK293,
HeLa, LCL |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1823561 | 42 |
GTG... |
VAK... |
GTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HeLa, hES | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 103738 | 90 |
GTG... |
VPA... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293, THP-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912641 | 93 |
CTT... |
LLL... |
CTT |
Alternative Downstream NMD sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912670 | 144 |
CGG... |
RKT... |
CGG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 103730 | 69 |
CTG... |
LFS... |
CTG |
NMD sORF Alternative Downstream |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 290114 | 30 |
ATG... |
MKM... |
ATG |
Downstream NMD sORF Alternative |
HeLa, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1131749 | 42 |
GTG... |
VKT... |
GTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6366 | 69 |
TTG... |
LEA... |
TTG |
Downstream NMD sORF |
BJ,
Blood,
Flp-In_T-REx-293,
guo_2014, HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408816 | 177 |
CCT... |
PGV... |
CCT |
ncRNA sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1131394 | 117 |
TTG... |
LRS... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 290127 | 36 |
TTG... |
LLL... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 482995 | 75 |
GTG... |
VER... |
GTG |
InCDS NMD Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 912666 | 42 |
TAT... |
YEY... |
TAT |
Alternative InCDS NMD Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 939314 | 105 |
TTG... |
LND... |
TTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
Brain, HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 636747 | 210 |
CTG... |
LVE... |
CTG |
Alternative NMD sORF Upstream |
BJ,
HEK293,
HEK293T,
HeLa, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 290125 | 33 |
CTG... |
LLS... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HEK293, HEK293T, HeLa, hES, HFF, LCL, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 408814 | 42 |
ACC... |
TKE... |
ACC |
Downstream NMD sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 103736 | 81 |
CTG... |
LRG... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293, THP-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1509484 | 39 |
CTG... |
LKA... |
CTG |
Alternative Downstream NMD sORF |
BJ,
HEK293,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6380 | 141 |
GTG... |
VRA... |
GTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HEK293T,
hES, MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 290131 | 99 |
CTG... |
LGA... |
CTG |
ncRNA sORF |
BJ,
HeLa,
LCL,
MDA-MB-231, MM1S, RPE-1, U2OS |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Export data