Gene
Gene
ID CARD
ID
HGNC:25935
Aliases
bA500G22.3
C10orf86,
ENSG00000107672,
FLJ20003
HGNC:25935,
NCBI:54780,
NSE4A
NSMCE4A,
OFF:NSMCE4A
Chromosome
10
Transcripts
64 ORFs
9 known transcripts
65 ORF to known transcript associations
MetamORF transcript ID The MetamORF ID of the transcript. This is an arbitrary ID that does not correspond to any official (Ensembl, NCBI...) transcript ID or external reference. |
Transcript ID
The official transcript ID (usually an Ensembl ID, e.g. ENST00000395565). |
Transcript name
The transcript name (e.g. MDK-202). |
Transcript biotype
The biotype of the transcript (as defined by Ensembl). |
ORFs
Display all the transcripts related to the entry. |
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460 | ENST00000465189 | NSMCE4A-205 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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454 | ENST00000483541 | NSMCE4A-210 | retained_intron | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
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899711 | ENST00000464321 | NSMCE4A-204 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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457 | ENST00000369017 | NSMCE4A-201 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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403830 | UNKNOWN_TRANSCRIPT | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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451 | ENST00000489266 | NSMCE4A-211 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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278845 | ENST00000468209 | NSMCE4A-206 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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900 | ENST00000369023 | NSMCE4A-202 | protein_coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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902130 | ENST00000459911 | NSMCE4A-203 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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1720029 | ENST00000472431 | NSMCE4A-207 | processed_transcript | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
ORFs
64 ORFs
9 known transcripts
65 ORF to known transcript associations
MetamORF ORF ID The MetamORF ID of the ORF. This is an unique ID referring to the ORF. |
ORF Length
The genomic length of the ORF (in bp). This length is defined as the sum of the lengths of each exon constituting the ORF (thus excluding its eventual introns) and includes both the start and the stop codons. |
Nucleic sequence The nucleic sequence of the ORF. |
Amino acid sequence The amino acid sequence of the ORF. |
Start codon
The start codon sequence of the ORF. |
ORF annotations
A comma-separated list of all the annotations computed by our algorithm for the ORF. This list includes the annotations computed for the ORF for all transcripts. See the section dedicated to ORF annotations in the advanced documentation for more details regarding the nomenclature we use. |
Cell types
A comma-separated list of all the cell types in which the ORF has already been identified. |
Transcripts
Display all the transcripts related to the entry. |
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899736 | 108 |
CGG... |
RGR... |
CGG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
453 | 99 |
CTG... |
LIP... |
CTG |
Intronic sORF |
HEK293, MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1817571 | 33 |
GTG... |
VMK... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
MM1S,
RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899710 | 33 |
CAC... |
HEL... |
CAC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
405589 | 294 |
GTC... |
VWG... |
GTC |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HCT116,
HEK293,
Jurkat
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899696 | 99 |
CAT... |
HSF... |
CAT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1134722 | 114 |
TTG... |
LNS... |
TTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
hES,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3304291 | 1158 |
ATG... |
MSG... |
ATG |
CDS |
HFF,
Brain_tumor,
HEK293,
HeLa |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899689 | 81 |
GTG... |
VEN... |
GTG |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899719 | 90 |
GAG... |
EQE... |
GAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899739 | 126 |
CAC... |
HRA... |
CAC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304101 | 249 |
CTG... |
LAR... |
CTG |
ncRNA sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899704 | 84 |
GGA... |
GRI... |
GGA |
InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2540410 | 57 |
ATG... |
MKK... |
ATG |
ncRNA sORF Alternative InCDS Overlapping |
HEK293,
Brain_tumor,
HeLa,
HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304097 | 210 |
TTG... |
LAL... |
TTG |
Overlapping sORF Upstream |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899728 | 180 |
CCG... |
PTK... |
CCG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899715 | 198 |
CTG... |
LSS... |
CTG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899 | 114 |
CTG... |
LIP... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
405585 | 90 |
GGT... |
GDK... |
GGT |
ncRNA sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
450 | 69 |
GTG... |
VKT... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
guo_2014,
HAP1, HEK293, HEK293T, HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231, RPE-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
902129 | 144 |
GAG... |
EGF... |
GAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899724 | 39 |
CCA... |
PSV... |
CCA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1093248 | 78 |
CTG... |
LRG... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
hES,
MM1S
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899722 | 183 |
CTC... |
LIN... |
CTC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
405583 | 123 |
GAA... |
EEL... |
GAA |
ncRNA sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1984004 | 69 |
ATG... |
MPT... |
ATG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
hES,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304099 | 222 |
TTG... |
LHG... |
TTG |
Overlapping sORF Upstream |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
405587 | 114 |
GGA... |
GFR... |
GGA |
ncRNA sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1817569 | 30 |
ATG... |
MKI... |
ATG |
ncRNA sORF Alternative InCDS Overlapping |
HeLa,
MM1S,
RPE-1,
Brain_tumor, HEK293, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98980 | 42 |
GTG... |
VIT... |
GTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
HAP1,
HEK293, HeLa, hES, MDA-MB-231, RPE-1, THP-1 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899702 | 51 |
AGT... |
SRK... |
AGT |
InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
900696 | 93 |
AGG... |
RRR... |
AGG |
InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1203506 | 39 |
GTG... |
VAL... |
GTG |
ncRNA sORF |
HAP1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278844 | 69 |
CTG... |
LLV... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
459 | 48 |
CTG... |
LKN... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
HeLa,
RPE-1
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2305998 | 300 |
CTG... |
LFN... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
hES,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1134724 | 54 |
GTG... |
VPP... |
GTG |
ncRNA sORF |
HEK293,
hES,
MDA-MB-231
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1134720 | 57 |
TTG... |
LFS... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899732 | 189 |
AGG... |
RRR... |
AGG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899734 | 264 |
GAC... |
DEM... |
GAC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899717 | 57 |
TTC... |
FRF... |
TTC |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899730 | 231 |
GAG... |
EAD... |
GAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
902140 | 135 |
AGA... |
RHI... |
AGA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
902132 | 120 |
GTT... |
VRN... |
GTT |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
98984 | 99 |
CTG... |
LNA... |
CTG |
ncRNA sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
279890 | 102 |
ATG... |
MKC... |
ATG |
sORF InCDS Overlapping Alternative |
HEK293,
hES,
LCL, MDA-MB-231, Brain_tumor, HeLa, HFF |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1314217 | 111 |
GTG... |
VVD... |
GTG |
Intronic sORF |
HEK293 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1720526 | 126 |
TTG... |
LKR... |
TTG |
InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
hES,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2540414 | 66 |
TTG... |
LIL... |
TTG |
Intronic sORF |
HEK293, RPE-1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
456 | 45 |
CTG... |
LCQ... |
CTG |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2304095 | 198 |
CTG... |
LGT... |
CTG |
InCDS Overlapping sORF |
MDA-MB-231 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278849 | 57 |
TTG... |
LFW... |
TTG |
ncRNA sORF |
BJ,
Blood,
HEK293,
HeLa, hES, LCL, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
278847 | 87 |
TTG... |
LSF... |
TTG |
ncRNA sORF |
HEK293, LCL | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3304297 | 951 |
ATG... |
MSG... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1720028 | 39 |
CTG... |
LED... |
CTG |
ncRNA sORF |
Blood,
HEK293,
HeLa,
hES, MDA-MB-231 |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3304294 | 519 |
ATG... |
MLR... |
ATG |
|
HFF | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899700 | 87 |
TGT... |
CPS... |
TGT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
405581 | 66 |
AAG... |
KTF... |
AAG |
ncRNA sORF |
HCT116 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899698 | 105 |
GAT... |
DPH... |
GAT |
Intronic sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
405579 | 57 |
GAG... |
EIS... |
GAG |
ncRNA sORF |
HCT116, Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899686 | 51 |
TCA... |
SEP... |
TCA |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899708 | 45 |
TGT... |
CDT... |
TGT |
Alternative InCDS Overlapping sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
899726 | 207 |
CAG... |
QIR... |
CAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
902138 | 120 |
AAG... |
KIL... |
AAG |
ncRNA sORF |
Jurkat | |||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Export data